在體內(nèi)富集組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子（TF）結(jié)合的DNA，隨后進(jìn)行qPCR和/或下一代測序，為研究全基因組蛋白質(zhì)-DNA相互作用提供了一個有利的工具。通常用于實現(xiàn)這一目標(biāo)的主要方法是免疫沉淀后測序（ChIP-seq）。這種方法包括高度特異的ChIP-exo和ChIP-nexus。這兩種實驗提供高分辨率的映射。然而，這些實驗的主要局限性在于它們需要大量的輸入材料、細(xì)胞或組織，以產(chǎn)生足夠強(qiáng)的信號，超過背景噪音。CUT&RUN（靶向裂解和核酸酶釋放）是為了使用有限的生物材料對蛋白質(zhì)-DNA相互作用進(jìn)行映射而開發(fā)的，它需要更少的樣品量，同時顯著提高了映射分辨率。然而，這種實驗的一個相當(dāng)大的缺點是抗體未耦合pAG-MNase的非特異性裂解，顯著限制了CUT&RUN在不同物種和細(xì)胞/組織類型中大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子的特異性使用。此外，原始CUT&RUN步驟繁瑣，需要優(yōu)化實驗條件，仍然耗時。

整合ChIP和CUT&RUN的所有優(yōu)勢，克服其缺點，EpiNext? CUT&LUNCH（靶向裂解并均勻解放獨特核酸復(fù)合物）檢測試劑盒可以在創(chuàng)紀(jì)錄的時間內(nèi)實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物的高度特異富集。

極速 3 步方案

為什么要花費數(shù)天時間進(jìn)行傳統(tǒng)的CUT&RUN或ChIP實驗，當(dāng)你可以在不犧牲性能的情況下更快地實現(xiàn)蛋白質(zhì)/DNA富集呢？使用EpigenTek的新CUT&LUNCH套件，你可以在僅一個早晨的實驗中迅速富集目標(biāo)蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物。

快速方案：在不到2小時內(nèi)完成實驗。

低非特異性背景：僅有3-5%的非特異性DNA結(jié)合。

高特異性和分辨率：DNA在富集目標(biāo)蛋白質(zhì)區(qū)域的兩端被選擇性地切割。

具有成本效益：與傳統(tǒng)的CUT&RUN實驗相比，每次反應(yīng)的價格幾乎是一半。

無需特殊軟件：使用現(xiàn)有經(jīng)過時間考驗的ChIP-seq生物信息學(xué)流程來進(jìn)行NGS數(shù)據(jù)分析。

不要讓冗長的實驗步驟耽誤你的一天。選擇CUT&LUNCH，獲得高效、高質(zhì)量的結(jié)果，符合你的時間表和預(yù)算。富集你的蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物，重新?lián)碛心愕奈绮蜁r間！

EpiNext CUT&LUNCH 檢測試劑盒包含了富集特定蛋白質(zhì)（組蛋白或強(qiáng)結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子）特異性DNA復(fù)合物所需的所有必要試劑，以通過qPCR或NGS從各種細(xì)胞樣品中分析蛋白質(zhì)和DNA之間的相互作用。在這個實驗中，細(xì)胞被滲透化并暴露在感興趣的ChIP級抗體中。通過使用獨特的核酸裂解酶混合物，靶向染色質(zhì)區(qū)域兩端的DNA序列被切除。被釋放的非特異性蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物被消除，只有結(jié)合抗體的復(fù)合物將被選擇性地回收。被捕獲的蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物中的DNA片段被純化，并可以直接用于基因特異性qPCR或DNA文庫構(gòu)建，以分析蛋白質(zhì)和DNA之間的相互作用。

高富集度，特異性增強(qiáng)