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DNA存儲著生物體賴以生存和繁衍的遺傳信息,因此維護(hù)DNA分子的完整性對細(xì)胞至關(guān)緊要。然而,在生命活動中,DNA時刻遭受著內(nèi)源性(氧化自由基、復(fù)制叉崩塌等)或外源性(電離輻射、烷化劑等)刺激,DNA損傷不可避免。

DNA損傷是復(fù)制過程中發(fā)生的DNA核苷酸序列永久性改變,并導(dǎo)致遺傳特征改變的現(xiàn)象。當(dāng)各種內(nèi)外源DNA損傷因子誘發(fā)細(xì)胞DNA鏈斷裂時,DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)受到破壞,在細(xì)胞裂解液作用下,細(xì)胞膜、核膜等膜結(jié)構(gòu)受到破壞,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA以及其它成分均擴(kuò)散到細(xì)胞裂解液中。DNA損傷后將會導(dǎo)致遺傳特征改變,基因功能喪失等現(xiàn)象。在疾病機(jī)制研究中,針對DNA損傷的檢測也是必不可少的。但都有什么方法可檢測細(xì)胞DNA損傷呢?
檢測DNA損傷的方法有很多,根據(jù)其原理大致可以分為3類:基于損傷DNA理化性質(zhì)的改變檢測DNA損傷、基于分子雜交檢測DNA損傷以及基于DNA損傷后形成的產(chǎn)物檢測DNA損傷。前兩種方法是基于熒光標(biāo)記直接觀測DNA的損傷情況,而基于DNA損傷后形成的產(chǎn)物檢測DNA損傷是通過標(biāo)記物的檢測間接反映DNA的損傷程度。
一、彗星實(shí)驗(yàn)—基于損傷DNA理化性質(zhì)的改變檢測DNA損傷
彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是一種在單細(xì)胞水平上檢測DNA損傷的技術(shù)。當(dāng)各種內(nèi)源性和外源性 DNA 損傷因子誘發(fā)細(xì)胞 DNA 鏈斷裂時,其超螺旋結(jié)構(gòu)受到破壞,在細(xì)胞裂解液作用下,細(xì)胞膜、核膜等膜結(jié)構(gòu)受到破壞,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、RNA 以及其他成分均擴(kuò)散到電解液中,而核DNA由于分子量太大不能進(jìn)入凝膠而留在原位。電泳過程中,如果DNA沒有損傷,則將停留在原位,染色后呈圓形的熒光團(tuán),無拖尾出現(xiàn)。如果DNA受損,斷裂的碎片進(jìn)入到凝膠中,在電場的作用下,DNA碎片離開原位向陽極遷移,形成拖尾。DNA受損越嚴(yán)重,斷裂越多,產(chǎn)生的碎片就越多、越小,則向陽極遷移的DNA碎片量就越多,遷移距離也越長,熒光染色后就能看見“彗星”樣尾長并且熒光強(qiáng)度增強(qiáng)。
這種方法檢測結(jié)果可信度較高,且能夠在成品試劑盒的選擇下得出漂亮的結(jié)果圖片。該種方法的優(yōu)點(diǎn)是具有高靈敏性,研究的細(xì)胞不需處于有絲分裂期。同時,這種技術(shù)只需要少量細(xì)胞。

二、TUNEL檢測—基于DNA損傷后形成的產(chǎn)物檢測DNA損傷
原位末端標(biāo)記法(TdT-mediated dUTP nick end labeling,TUNEL)是一種檢測凋亡細(xì)胞DNA鏈斷裂片段的方法。細(xì)胞凋亡發(fā)生時,內(nèi)源性核酸內(nèi)切酶將DNA降解成片段,在脫氧核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶的作用下,底物dUTP 或BrDU(無或有熒光標(biāo)記)可連接到DNA斷片的3-OH末端,采用熒光顯微鏡對標(biāo)記物進(jìn)行分析,可以特異精準(zhǔn)的定位出正在凋亡的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)在單細(xì)胞水平檢測凋亡細(xì)胞的DNA碎片。
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