我們提供最全面的染色質(zhì)研究產(chǎn)品，涵蓋實驗流程的每一步，從上游到下游。借助EpigenTek的染色質(zhì)研究產(chǎn)品系列，拓展您對染色質(zhì)的理解：

什么是染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）？

染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）是研究染色質(zhì)相關(guān)修飾最常用的方法之一。它是一種通過特定蛋白質(zhì)與基因組DNA區(qū)域結(jié)合的過程。這種流行的ChIP實驗為表觀遺傳學(xué)研究人員提供了關(guān)于某些蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)修飾與特定DNA序列相互作用的寶貴信息。

蛋白質(zhì)與DNA的相互作用對細(xì)胞功能至關(guān)重要，例如DNA復(fù)制和重組、基因轉(zhuǎn)錄、染色體分離、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)以及表觀遺傳沉默。了解蛋白質(zhì)與DNA的相互作用可用于比較兩個不同群體（如疾病組織和健康組織）中與特定基因啟動子區(qū)域相關(guān)的組蛋白甲基化水平。染色質(zhì)免疫沉淀方法還可以用于繪制其他各種組蛋白修飾的基因組定位。

染色質(zhì)研究步驟細(xì)節(jié)

1. 分離提取染色質(zhì)

染色質(zhì)是由DNA和蛋白質(zhì)組成的復(fù)合體，它將DNA壓縮到更小的體積中以便容納在細(xì)胞內(nèi)，幫助防止DNA損傷，并控制基因表達(dá)和DNA復(fù)制。正確分離染色質(zhì)樣本是研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用實驗中的一個重要因素。EpiGentek的專利染色質(zhì)分離試劑盒采用多種方法，確保從哺乳動物或植物細(xì)胞和組織中提取完整染色質(zhì)的高質(zhì)量分離。

2. 染色質(zhì)可及性分析

染色質(zhì)結(jié)構(gòu)是基因調(diào)控的重要決定因素之一，而其中的關(guān)鍵因素是染色質(zhì)對轉(zhuǎn)錄因子和其他DNA結(jié)合蛋白的可及性。一般來說，染色質(zhì)越緊密，轉(zhuǎn)錄因子和其他DNA結(jié)合蛋白就越難以接近DNA并執(zhí)行其功能。相反，DNA的可及性越高，周圍基因被積極轉(zhuǎn)錄的可能性就越大。研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的可及性具有特別重要的意義，因為它可以提供有關(guān)核小體存在與否的信息，而核小體的存在與否會直接影響或間接影響一系列其他細(xì)胞和代謝過程。

3. 染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）

由于蛋白質(zhì)與DNA的相互作用在細(xì)胞功能中起著至關(guān)重要的作用，識別DNA結(jié)合蛋白的遺傳靶點并了解蛋白質(zhì)-DNA相互作用的機制對于理解細(xì)胞過程至關(guān)重要。染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）是研究人員用于研究這些相互作用的工具之一。ChIP相較于其他方法的優(yōu)勢在于，它能夠在活細(xì)胞中檢測特定蛋白質(zhì)與基因特定序列的結(jié)合。EpiGentek提供了一系列實驗試劑盒解決方案，幫助您的實驗室高效、準(zhǔn)確且可重復(fù)地開展基于ChIP的實驗。

4.PCR/測序（ChIP-Seq）NGS分析

進(jìn)一步推動這一過程，下一代測序（NGS）技術(shù)提高了數(shù)據(jù)產(chǎn)出量，并降低了ChIP測序的成本。ChIP-Seq將已經(jīng)討論過的染色質(zhì)免疫沉淀過程與下一代測序方法相結(jié)合，提供了一種有效的方法，用于識別轉(zhuǎn)錄因子和其他蛋白質(zhì)的全基因組DNA結(jié)合位點。ChIP-Seq的優(yōu)勢在于能夠在全基因組水平上解析目標(biāo)蛋白結(jié)合位點的特定遺傳序列。實時定量PCR（RT-qPCR）則通過使用特異性引物進(jìn)行選擇性擴增，分析修飾組蛋白和/或其他DNA結(jié)合蛋白在精確位點的結(jié)合位點，提供了一種替代方法。EpiGentek提供了多種經(jīng)濟實惠的PCR和NGS解決方案，包括完整的試劑盒套餐，方便從低量或難以處理的樣本中構(gòu)建高質(zhì)量的DNA文庫。

5.CUT&RUN-Fast/CUT&TAG原位

染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）是一種用于研究細(xì)胞中全基因組范圍內(nèi)蛋白質(zhì)/DNA相互作用的常用工具，通過富集目標(biāo)組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合的DNA，并通過下一代測序技術(shù)繪制相互作用區(qū)域。由于ChIP存在以下局限性：1）需要大量的起始材料；2）處理時間長；3）分辨率低，靶向切割與核酸酶釋放技術(shù)（CUT&RUN）應(yīng)運而生，以解決這些問題。該技術(shù)在未經(jīng)固定的完整細(xì)胞或細(xì)胞核中原位進(jìn)行，通過pAG-MNase融合蛋白在特定抗體占據(jù)位點處切割染色質(zhì)，并釋放蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物。與ChIP相比，CUT&RUN具有諸多優(yōu)勢，包括需要的起始材料少、分辨率更高。該技術(shù)采用了一種新穎且獨特的核酸酶混合物，具有低序列偏好性，能夠同時對染色質(zhì)進(jìn)行片段化，并在目標(biāo)蛋白/DNA復(fù)合物的兩端切割/移除任何DNA序列，而不影響目標(biāo)蛋白占據(jù)的DNA，從而提高了特異性和分辨率。

6. CUT&LUNCH

EpigenTek進(jìn)一步改進(jìn)了CUT&RUN方法，推出了新的CUT&LUNCH（靶向切割與均勻釋放獨特核酸復(fù)合物）技術(shù)，該技術(shù)具有極快的實驗流程、進(jìn)一步增強的特異性以及最小化的背景信號。

CUT&LUNCH實驗的簡化流程能夠讓您快速選擇性富集目標(biāo)蛋白/DNA復(fù)合物。快速的三步實驗流程可在不到2小時內(nèi)完成，最大限度減少細(xì)胞核損傷和染色質(zhì)丟失，同時保留天然染色質(zhì)結(jié)構(gòu)：

第一步：抗體與目標(biāo)結(jié)合（30分鐘）

第二步：酶切割（10分鐘）

第三步：選擇性回收與純化（60分鐘）