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Caspases酶系列1:底物及抑制劑

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時(shí)間:2021-01-20     
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       最近很多小伙伴向我們咨詢各種Caspase的底物,今天小艾就來(lái)跟大家好好聊聊Caspase家族及各類Caspase酶對(duì)應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過(guò)程密切相關(guān)。

 

Caspase.png

 

       什么是胱天蛋白酶?

      胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(hào)(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會(huì)參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。

 

      人Caspases酶

      人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長(zhǎng)胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對(duì)P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長(zhǎng)的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。

 

       表1. 人胱天蛋白酶的功能分類

 

細(xì)胞死亡途徑半胱天冬酶類型酵素物種
細(xì)胞凋亡啟動(dòng)器Caspases 2人與鼠
細(xì)胞凋亡啟動(dòng)器Caspases 8人與鼠
細(xì)胞凋亡啟動(dòng)器Caspases 9人與鼠
細(xì)胞凋亡啟動(dòng)器Caspases 10人的
細(xì)胞凋亡效應(yīng)器Caspases 3人與鼠
細(xì)胞凋亡效應(yīng)器Caspases 6人與鼠
細(xì)胞凋亡效應(yīng)器Caspases 6人與鼠
細(xì)胞焦亡炎性的Caspases 1人與鼠
細(xì)胞焦亡炎性的Caspases 4人的
細(xì)胞焦亡炎性的Caspases 5人的

 

       啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase

      根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:?jiǎn)?dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識(shí)別位

 

Caspase-enzyme.jpg

 

      凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對(duì)于形成死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對(duì)IETD肽序列具有相對(duì)較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級(jí)聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們?cè)诩?jí)聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖?lái)自啟動(dòng)器Caspase的信號(hào),使用對(duì)Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對(duì)活化的Caspase-3進(jìn)行檢測(cè),可以檢測(cè)Caspase-3的活性。

 

       Caspase酶底物和抑制劑

      Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識(shí)別序列和信號(hào)產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識(shí)別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識(shí)別序列的N端通常有乙酰基(Ac)碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對(duì)應(yīng)的Caspase識(shí)別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號(hào)或抑制信號(hào)的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號(hào)或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。

 

       表2. Caspase底物及其序列

 

多肽氨基酸序列對(duì)應(yīng)的Caspase的種類
IETDIle-Glu-Thr-AspCaspase 8,顆粒酶B
DEVDAsp-Glu-Val-AspCaspase 3、6、7、8或10
LEHDLeu-Glu-His-AspCaspase 9
VADVal-Ala-AspCaspase 1、2、3、6、8、9或10

   

       Caspase的顯色底物

      Caspase的顯色底物是有Caspase識(shí)別序列及生色基團(tuán)組成,常見(jiàn)的生色團(tuán)有pNA(對(duì)硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測(cè)。

 

       表3. Caspase的顯色底物

 

底物Caspase吸收(nm)顏色規(guī)格貨號(hào)
Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 *半胱天冬酶3405 nm黃色5 mg13405
Z-DEVD-pNA半胱天冬酶3405 nm黃色5 mg13422
Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 *半胱天冬酶8,顆粒酶B405 nm黃色5 mg13413

 

       Caspase的熒光底物

      Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識(shí)別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過(guò)程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測(cè)定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定。

 

Caspase-substrate.jpg

 

      圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。

 

       表4.熒光半胱天冬酶底物。

 

底物名稱對(duì)應(yīng)的CaspaseEx(nm)Em(nm)ε¹Φ²規(guī)格貨號(hào)
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 *半胱天冬酶3、7376482170000.535mg13401
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 *半胱天冬酶3、734144119000N / D5mg13402
Z-DEVD-AFC半胱天冬酶3、7376482170000.535mg13420
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 *半胱天冬酶3、734144119000N / D5mg13421
Z-DEVD-ProRed™620半胱天冬酶3、7532619N / DN / D1mg13433
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 *半胱天冬酶3、750052280000N / D1mg13430
Z-DEVD-ProRed™620半胱天冬酶3、7532619N / DN / D1mg13433
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 *半胱天冬酶8,顆粒酶B376482170000.535mg13410
交流電-IETD-AMC半胱天冬酶8,顆粒酶B34144119000N / D5mg13411
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 *半胱天冬酶8,顆粒酶B376482170000.535mg13425

 

       注意

 

        1.ε=在其最大吸收波長(zhǎng)處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。

      2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率

 

       Caspase抑制劑

      Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識(shí)別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。

 

       表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑

 

抑制劑Caspase的種類是否可逆Ex(nm)Em(nm)規(guī)格貨號(hào)
Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 *半胱天冬酶3、7可逆的----1mg13403
Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 *半胱天冬酶8可逆的----5mg13412
mFluor™450-VAD-FMK半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10不可逆的40644525 tests13475
mFluor™510-VAD-FMK半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10不可逆的41250525 tests13476
FITC-C6-DEVD-FMK半胱天冬酶3、7不可逆的4915161mg13406
FITC-C6-DEVD-FMK半胱天冬酶3、7不可逆的491516100ug13408
FITC-C6-LEHD-FMK半胱天冬酶9不可逆的4915161mg13407
FITC-C6-LEHD-FMK半胱天冬酶9不可逆的491516100ug13409
FAM-VAD-FMK半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10不可逆的49351725 tests13470
SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK]半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10不可逆的55957725 tests13472


 

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