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前期回顧:SARS-CoV-2靶向檢測試劑盒相關(guān)研究
光陰似箭,日月如梭,時間箭矢從過去“嗖”的一下來到了中國農(nóng)歷2020年的年末,想想還有半個月就要過年了,大家是否在期待“爆竹聲中辭舊歲”呢?雖然現(xiàn)在禁止放煙花爆竹~~~不過,就今年而言,我想現(xiàn)在大家更多的是想爆竹聲中病毒除吧——新冠病毒。雖然該病毒從未完全消滅過,但是現(xiàn)在的卷土而來,并且來勢洶洶導(dǎo)致很多人都沒有辦法回到老家與家人團圓,同時也限制了我們的出行和吃穿方面,小編過年是要回老家的,回家就要做核酸檢測,昨天在網(wǎng)上預(yù)約核酸檢測,很多檢測機構(gòu)到7號都預(yù)約滿了,心累。也真心希望在牛年里,病毒能夠真的被除去了。
說到病毒,拿我們現(xiàn)在賊討厭的新冠病毒COVID-19: SARS-coV-2來舉例,它的遺傳物質(zhì)是RNA。如果SARS-CoV-2大流行給我們帶來了任何啟示,那么對RNA修飾的研究現(xiàn)在比以往任何時候都更加重要。 這是否意味著要研究病毒RNA本身以更多地了解不同的改變和表觀遺傳學(xué)變化如何使這些病毒更具彈性和更具感染力,或者研究從細(xì)胞和組織中收集的RNA以了解這些不同病原體對宿主細(xì)胞功能的影響,這項研究努力幾乎是無盡的。RNA m6A的原理和概念我今日就不再贅述,今天就開門見山的聊聊病毒 RNA m6A.
一 m6A修飾對RNA病毒生命周期的影響
已知表觀遺傳修飾會影響人冠狀病毒等RNA病毒的生命周期。據(jù)報道,像N6-甲基腺苷(m6A)這樣的修飾腺苷通過調(diào)節(jié)病毒帽結(jié)構(gòu)、病毒基因表達(dá)、病毒子代、先天性感應(yīng)途徑和先天性免疫反應(yīng)來影響特定RNA病毒的生存能力。m6A的獲得或喪失可導(dǎo)致RNA病毒發(fā)生顯著的功能變化,改變宿主細(xì)胞的融合/進入、復(fù)制、傳播、病原體強度和免疫逃避。宿主細(xì)胞的m6A表型組在宿主抵抗力中起著重要作用,病毒感染后也可發(fā)生改變。SARS-CoV-2基因組長度超過29800個核苷酸,根據(jù)RNA甲基化酶復(fù)合物METTL3/14對m6A修飾的特定序列座的存在,包括GGACU(T)、GGACA和GGACC,包含50多個潛在的m6A位點。因此,SARS-CoV-2 RNA中>0.64%的腺苷,或0.18%的堿基可能是m6A。因此,總RNA中m6A的定量和全轉(zhuǎn)錄組m6A圖譜的繪制對于研究m6A相關(guān)的病毒功能和相應(yīng)的機制,以及確定新的抗病毒治療靶點至關(guān)重要。
二 病毒RNA提取
無論您是從細(xì)胞,組織還是病毒的樣品開始,有效的RNA分離通常是成功進行實驗的第一步。對于病毒:另一方面,當(dāng)涉及病毒樣品時,諸如病毒滴度低和污染性宿主核酸的高存在之類的挑戰(zhàn)需要使用補充技術(shù)來確保產(chǎn)量和純度符合下游要求。在我們最近的公告文章中,我們概述了可以完成此操作的10種方法(欲知更多詳情,請咨詢小艾獲取喲),因此您可以將其應(yīng)用到最適合您的學(xué)習(xí)的方法中。一種方法是接種細(xì)胞培養(yǎng)物進行病毒擴增,然后收集擴增的病毒體,以與EpiGentek的病毒RNA提取試劑盒一起使用。注意:對于直接從臨床標(biāo)本中提取的病毒RNA,在m6A RNA富集之前,需要額外的處理以去除共提取的宿主DNA和rRNA污染物。
三 病毒RNA提取試劑盒
病毒RNA提取產(chǎn)品我們主要有2種:RNA穩(wěn)健的旋轉(zhuǎn)柱和磁性試劑盒我們的每一個試劑盒都是為了提取高質(zhì)量的RNA而設(shè)計的,除了用于RT-PCR之外,還可以用于其他下游應(yīng)用。我們的試劑盒在提取方法以及通量選項(高/手動)的類型上有所不同,因此無論您的實驗室需要什么,我們的試劑盒都可以幫助您獲得隨時可用的純化病毒RNA。我們的各種磁珠和自旋柱試劑盒可以從不同的樣品來源(鼻腔/鼻咽拭子、細(xì)胞/組織)和物種(病毒、哺乳動物)中分離RNA。洗滌劑和潮解鹽用于裂解細(xì)胞和滅活RN酶。專門的高鹽緩沖系統(tǒng)使RNA堿基與磁珠結(jié)合到自旋柱的玻璃纖維基質(zhì)上,同時污染物被有效地洗去。純核酸用水緩沖液洗脫,不需要苯酚提取或酒精沉淀。具體操作流程如下:

產(chǎn)品:
| 貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 描述 |
| P-9107 (旋轉(zhuǎn)柱) | EpiQuik Viral RNA Isolation Fast Kit | EpiQuik病毒RNA分離快速試劑盒是一整套優(yōu)化的緩沖液和試劑,適用于從無細(xì)胞液體樣本(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA。旋轉(zhuǎn)柱法純化。10min。 |
| P-9108 (磁珠法) | EpiMag Viral RNA Isolation Kit (Magnetic Beads) | 適用于從無細(xì)胞液體樣品(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA,磁珠法,25min。 |
| P-9109 (磁珠法) | EpiMag 96-Well Viral RNA Extraction Kit (High Throughput) | 適用于從無細(xì)胞液體樣品(不含血漿和血清)中制備磁珠,以高通量方式快速制備病毒RNA。 ),高通量,磁珠法,30min。 |
結(jié)果:
P-9107

p-9108:

p-9109:

以上便是本期全部內(nèi)容,大家想要了解更多病毒RNA提取和純化方面的信息,請咨詢小艾喲!
下期為大家?guī)?strong>病毒RNA m6A甲基化研究方面的產(chǎn)品和信息,敬請期待~~
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艾美捷科技與國內(nèi)外優(yōu)秀的生物試劑供應(yīng)商優(yōu)保持著密切的合作關(guān)系,目前已成為眾多國際知名品牌的中國總代理或一級代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Abbexa、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、ImmunoReagents、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、Mabtech、Matreya、Norgen Biotek、Origene 、ProSpec、ProImmune、StressMarq、ScyTek 、SouthernBiotech、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短時間內(nèi)為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品及物流服務(wù)。
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