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FRET新助力,肽和寡核苷酸熒光標(biāo)記工具

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時間:2020-08-12     
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       前情回顧:

 

      生物素標(biāo)記工具

      鏈霉親和素標(biāo)工具

      熒光蛋白標(biāo)記工具

 

      熒光染料標(biāo)記的肽和寡核苷酸是生化和細(xì)胞研究中的重要工具,目前熒光肽和寡核苷酸已廣泛用于所有主要類型的熒光成像中,包括熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),這些標(biāo)記的生物分子被廣泛用于基于分子信標(biāo)和其他技術(shù)的傳染病診斷。FRET肽和寡核苷酸也已通過熒光相關(guān)細(xì)胞分選(FACS)用于細(xì)胞分析,用于體內(nèi)或體外的研究和診斷目的。

    

       肽和蛋白質(zhì)分子量計(jì)算器:

 

       為了幫助您計(jì)算寡肽和蛋白的分子量,請使用我們的在線計(jì)算器,肽和蛋白質(zhì)分子量計(jì)算器https://www.aatbio.com/tools/calculate-peptide-and-protein-molecular-weight-mw

 

       用于熒光標(biāo)記染料

 

      根據(jù)肽/寡核苷酸的序列,可以通過共價鍵將熒光染料在特定點(diǎn)連接至肽/寡核苷酸。染料和肽/寡核苷酸之間的連接是共價鍵,在大多數(shù)生物學(xué)條件下較穩(wěn)定且不會被破壞。在某些情況下,在染料和肽/寡核苷酸之間引入功能性接頭來使肽/寡核苷酸生物活性改變最小,對于所有的肽/寡核苷酸標(biāo)記,染料都必須連接在確定的位置。通常,優(yōu)選的熒光標(biāo)記應(yīng)具有高的熒光量子產(chǎn)率并保留未標(biāo)記生物分子的生物學(xué)活性。

 

      我們?yōu)榇蠹姨峁┝硕喾N類型熒光標(biāo)記染料,便于染料與用于生物學(xué)研究的肽/寡核苷酸的結(jié)合,這些熒光染料包括香豆素熒光素羅丹明花青素,其中,我們的Tide Fluor™,California Red™,SunRed™和Helix Fluor™染料經(jīng)過優(yōu)化,可標(biāo)記肽和寡核苷酸。

 

       花青染料家族和其他經(jīng)典染料

 

花青素染料家族

 

      圖1.將 HeLa細(xì)胞與tubulin抗體孵育,然后與Cy5®山羊抗小鼠IgG偶聯(lián)物(紅色)一起孵育。細(xì)胞核用Hoechst 33342(藍(lán)色,Cat# 17530)染色。

 

      盡管現(xiàn)代染料(例如iFluor™染料)通常用于更具挑戰(zhàn)性的生物學(xué)應(yīng)用,但經(jīng)典的熒光標(biāo)記染料有時因其較低的成本而非常適用于某些要求不高的應(yīng)用。在經(jīng)典的標(biāo)記染料中,cyanines是最受歡迎的選擇之一,其他染料包括FAM,TAMRA和TexasRed®,也都可以用于偶聯(lián)肽和寡核苷酸。

 

       花青素染料家族和其他用于熒光標(biāo)記染料的經(jīng)典染料:

 

花青染料激光Ex / Em(nm)濾光片組消光系數(shù)(ε)量子產(chǎn)率(Φ)
Cy3532 nm554/568 nmCy3 / TRITC150,0000.15
Cy5633-647 nm650/669 nmCy5250,0000.27
Cy7730 nm754/778 nmCy7250,0000.3

 

       Tide Fluor™系列染料


      Tide Fluor™染料經(jīng)過優(yōu)化,可作為開發(fā)FRET寡核苷酸和肽的基礎(chǔ),我們的Tide Fluor™染料比香豆素,熒光素,羅丹明和花青素等經(jīng)典標(biāo)記染料具有更強(qiáng)的熒光,更高的光穩(wěn)定性。

 

Tide Fluor™系列染料

 

       用于熒光標(biāo)記的Tide Fluor™系列染料

 

貼標(biāo)染料Ex(nm)Em(nm)消光系數(shù)(ε)量子產(chǎn)率CF260CF280
Tide Fluor™1345442200000.950.2460.187
Tide Fluor™2WS502525750000.90.2110.091
Tide Fluor™2500527750000.90.2880.201
Tide Fluor™3WS5555651500000.1050.0790.079
Tide Fluor™3555584850000.850.3310.201
Tide Fluor™4590618900000.910.4890.436
Tide Fluor™5WS6496642500000.250.0230.027
Tide Fluor™6WS6766952200000.180.1110.009
Tide Fluor™7WS7497752750000.120.0090.049
Tide Fluor™8WS7758072500000.080.1030.109

 

     CF260是染料在260 nm處的校正因子,用于消除染料對260 nm處的吸光度的影響(用于寡核苷酸和核酸標(biāo)記)

     CF280是染料280 nm處的校正因子,用于消除染料對280 nm處的吸光度的影響(用于肽和蛋白質(zhì)標(biāo)記)

 

       其他系列染料

 

     我們的California Red™,Sunnyvale Red™和Helix Fluor™染料非常適合對寡核苷酸和肽進(jìn)行強(qiáng)大,高效的標(biāo)記。這些系列具有改進(jìn)的性能和亮度,仍然與傳統(tǒng)的熒光標(biāo)記染料(例如FAM,TET,VIC,JOE,NED,TAMRA和ROX)檢測平臺兼容。

 

       其他熒光標(biāo)記系列染料:

 

貨號產(chǎn)品名稱Ex(nm)Em(nm)規(guī)格
250Helix Fluor™545,琥珀酰亞胺酯5255451mg
251Helix Fluor™575,琥珀酰亞胺酯5465751mg
394Sunnyvale Red™SE *替代6-ROX *5766055mg
473California Red™ SE5836035mg
479California Red™ SE5836031mg

 

       不用于熒光標(biāo)記染料

 

      蛋白酶參與許多生理過程, 蛋白酶的檢測和特定蛋白酶抑制劑的篩選對于發(fā)現(xiàn)用于治療和管理蛋白酶相關(guān)疾病的潛在藥物至關(guān)重要,各種供體和受體分子(熒光的或非熒光的)附著在肽/蛋白質(zhì)上(形成內(nèi)部淬滅的結(jié)合物),并根據(jù)氨基酸序列用于檢測蛋白酶。精心選擇供體和受體分子,使受體的激發(fā)波長與供體發(fā)射波長重疊,從而確保熒光通過共振能量轉(zhuǎn)移而淬滅,底物的酶水解導(dǎo)致供體和受體分子的空間分離,從而恢復(fù)供體熒光。

 

       FRET原理

 

      熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種物理現(xiàn)象,在生物醫(yī)學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)中已經(jīng)越來越流行。FRET是能量從供體分子(donor)到受體分子(acceptor)的無熱量傳輸。供體分子是最初吸收能量的熒光基團(tuán),而受體是隨后轉(zhuǎn)移能量的熒光基團(tuán),這種共振相互作用發(fā)生在大于原子間的距離上,而沒有轉(zhuǎn)化為熱能并且沒有任何分子碰撞。能量轉(zhuǎn)移導(dǎo)致供體的熒光強(qiáng)度和激發(fā)態(tài)壽命的減少,以及受體的發(fā)射強(qiáng)度的增加。以發(fā)生FRET的方式相互作用的一對分子通常稱為供體/受體對。由于它對距離敏感,F(xiàn)RET被用于觀察分子間相互作用。

 

熒光共振能量轉(zhuǎn)移

      圖2. 從供體到受體分子的FRET過程圖。水平線代表每個分子的離散電子能級。能級被標(biāo)記為單峰態(tài)(S)或三重態(tài)(T),其下標(biāo)分別為0,1或2(分別代表基態(tài),第一激發(fā)態(tài)或第二激發(fā)態(tài))。分子的電子通常處于基態(tài)S0。電子可以通過許多過程被激發(fā)到更高的能級,包括光吸收和化學(xué)反應(yīng)。

 

      盡管有很多影響FRET的因素,但要使FRET發(fā)生需要滿足的主要條件相對較少:

      供體和受體分子必須彼此接近(通常為10-100Å)

      受體的激發(fā)光譜必須與供體的發(fā)射光譜重疊。它們重疊的程度稱為光譜重疊積分(J)

      供體和受體過渡偶極的方向必須近似平行

 

      假設(shè)供體受體對是相匹配的,發(fā)生FRET所必需的最關(guān)鍵元素是供體受體對之間的緊密接近。Förster證明了過程(E)的效率取決于供體與受體之間距離的六次方的倒數(shù),如以下等式所示:

 

 

E = R o 6 /(R o 6 + r 6

 

 

      其中Ro是能量傳遞一半時的Förster距離,r是供體與受體之間的實(shí)際距離。Ro的大小取決于體與受體的光譜性質(zhì)。Förster距離在20到90Å之間時,對研究生物大分子最有用。

 

       Tide Quencher™系列

 

      盡管DABCYL已被用于開發(fā)各種FRET應(yīng)用,但對于較長波長的染料(例如熒光素,羅丹明和花青素)的淬滅效率較低,限制了其在敏感的熒光FRET探針開發(fā)中的應(yīng)用。另外,DABCYL的吸收光譜對環(huán)境敏感。我們已開發(fā)出耐用的Tide Quencher™受體染料,用于研發(fā)更長波長的FRET探針,Tide Quencher™染料是消除經(jīng)典淬滅劑限制的絕佳選擇。

 

Tide Quencher™

      Tide Quencher™染料的主要優(yōu)點(diǎn):

      探索其他淬滅劑可能無法實(shí)現(xiàn)的FRET潛力

      多種反應(yīng)形式便于自我構(gòu)建所需的FRET生物分子

      與您所需的熒光供體完全匹配

      性價比高

 

       Tide Quencher™系列產(chǎn)品:

 

淬滅劑激發(fā)(nm)消光系數(shù)(ε)CF260CF280
Tide Quencher™148820,0000.1470.194
Tide Quencher™251221,0000.1000.120
Tide Quencher™2WS51521,0000.1000.120
Tide Quencher™357622,0000.0850.091
Tide Quencher™3WS57690,0000.1860.205
Tide Quencher™460423,0000.1460.183
Tide Quencher™4WS60490,0000.1490.136
Tide Quencher™566124,0000.1700.082
Tide Quencher™5WS661130,0000.0720.082
Tide Quencher™6WS691130,0000.1200.102

 

      CF260是染料在260 nm處的校正因子,用于消除染料對260 nm處的吸光度的影響(用于寡核苷酸和核酸標(biāo)記)

      CF280是染料280 nm處的校正因子,用于消除染料對280 nm處的吸光度的影響(用于肽和蛋白質(zhì)標(biāo)記)

 

 

      作為一家具有高端的技術(shù)實(shí)力、先進(jìn)的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè),總部位于武漢光谷高新技術(shù)開發(fā)區(qū),服務(wù)面向全國。艾美捷科技是集進(jìn)口試劑、實(shí)驗(yàn)室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品、整合的解決方案,及優(yōu)質(zhì)的物流服務(wù)。為了更好的服務(wù)客戶,公司組建了一支經(jīng)驗(yàn)豐富的研發(fā)團(tuán)隊(duì)-艾美捷生物技術(shù)中心,進(jìn)入研發(fā)生產(chǎn)階段,將更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品推薦給國內(nèi)生物領(lǐng)域的同仁們!

 

      艾美捷科技與國內(nèi)外優(yōu)秀的生物試劑供應(yīng)商優(yōu)保持著密切的合作關(guān)系,目前已成為眾多國際知名品牌的中國總代理或一級代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、ProSpec、Norgen Biotek、Mabtech、Matreya、iRegene、StressMarq、ImmunoReagents、SouthernBiotech、Origene、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短時間內(nèi)為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品及物流服務(wù)。


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