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前情回顧:
熒光染料標(biāo)記的肽和寡核苷酸是生化和細(xì)胞研究中的重要工具,目前熒光肽和寡核苷酸已廣泛用于所有主要類型的熒光成像中,包括熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),這些標(biāo)記的生物分子被廣泛用于基于分子信標(biāo)和其他技術(shù)的傳染病診斷。FRET肽和寡核苷酸也已通過熒光相關(guān)細(xì)胞分選(FACS)用于細(xì)胞分析,用于體內(nèi)或體外的研究和診斷目的。
肽和蛋白質(zhì)分子量計(jì)算器:
為了幫助您計(jì)算寡肽和蛋白的分子量,請使用我們的在線計(jì)算器,肽和蛋白質(zhì)分子量計(jì)算器:https://www.aatbio.com/tools/calculate-peptide-and-protein-molecular-weight-mw
用于熒光標(biāo)記染料
根據(jù)肽/寡核苷酸的序列,可以通過共價鍵將熒光染料在特定點(diǎn)連接至肽/寡核苷酸。染料和肽/寡核苷酸之間的連接是共價鍵,在大多數(shù)生物學(xué)條件下較穩(wěn)定且不會被破壞。在某些情況下,在染料和肽/寡核苷酸之間引入功能性接頭來使肽/寡核苷酸生物活性改變最小,對于所有的肽/寡核苷酸標(biāo)記,染料都必須連接在確定的位置。通常,優(yōu)選的熒光標(biāo)記應(yīng)具有高的熒光量子產(chǎn)率并保留未標(biāo)記生物分子的生物學(xué)活性。
我們?yōu)榇蠹姨峁┝硕喾N類型熒光標(biāo)記染料,便于染料與用于生物學(xué)研究的肽/寡核苷酸的結(jié)合,這些熒光染料包括香豆素,熒光素,羅丹明和花青素,其中,我們的Tide Fluor™,California Red™,SunRed™和Helix Fluor™染料經(jīng)過優(yōu)化,可標(biāo)記肽和寡核苷酸。
花青素染料家族和其他經(jīng)典染料

圖1.將 HeLa細(xì)胞與tubulin抗體孵育,然后與Cy5®山羊抗小鼠IgG偶聯(lián)物(紅色)一起孵育。細(xì)胞核用Hoechst 33342(藍(lán)色,Cat# 17530)染色。
盡管現(xiàn)代染料(例如iFluor™染料)通常用于更具挑戰(zhàn)性的生物學(xué)應(yīng)用,但經(jīng)典的熒光標(biāo)記染料有時因其較低的成本而非常適用于某些要求不高的應(yīng)用。在經(jīng)典的標(biāo)記染料中,cyanines是最受歡迎的選擇之一,其他染料包括FAM,TAMRA和TexasRed®,也都可以用于偶聯(lián)肽和寡核苷酸。
花青素染料家族和其他用于熒光標(biāo)記染料的經(jīng)典染料:
| 花青染料 | 激光 | Ex / Em(nm) | 濾光片組 | 消光系數(shù)(ε) | 量子產(chǎn)率(Φ) |
| Cy3 | 532 nm | 554/568 nm | Cy3 / TRITC | 150,000 | 0.15 |
| Cy5 | 633-647 nm | 650/669 nm | Cy5 | 250,000 | 0.27 |
| Cy7 | 730 nm | 754/778 nm | Cy7 | 250,000 | 0.3 |
Tide Fluor™系列染料
Tide Fluor™染料經(jīng)過優(yōu)化,可作為開發(fā)FRET寡核苷酸和肽的基礎(chǔ),我們的Tide Fluor™染料比香豆素,熒光素,羅丹明和花青素等經(jīng)典標(biāo)記染料具有更強(qiáng)的熒光,更高的光穩(wěn)定性。

用于熒光標(biāo)記的Tide Fluor™系列染料:
| 貼標(biāo)染料 | Ex(nm) | Em(nm) | 消光系數(shù)(ε) | 量子產(chǎn)率 | CF260 | CF280 |
| Tide Fluor™1 | 345 | 442 | 20000 | 0.95 | 0.246 | 0.187 |
| Tide Fluor™2WS | 502 | 525 | 75000 | 0.9 | 0.211 | 0.091 |
| Tide Fluor™2 | 500 | 527 | 75000 | 0.9 | 0.288 | 0.201 |
| Tide Fluor™3WS | 555 | 565 | 150000 | 0.105 | 0.079 | 0.079 |
| Tide Fluor™3 | 555 | 584 | 85000 | 0.85 | 0.331 | 0.201 |
| Tide Fluor™4 | 590 | 618 | 90000 | 0.91 | 0.489 | 0.436 |
| Tide Fluor™5WS | 649 | 664 | 250000 | 0.25 | 0.023 | 0.027 |
| Tide Fluor™6WS | 676 | 695 | 220000 | 0.18 | 0.111 | 0.009 |
| Tide Fluor™7WS | 749 | 775 | 275000 | 0.12 | 0.009 | 0.049 |
| Tide Fluor™8WS | 775 | 807 | 250000 | 0.08 | 0.103 | 0.109 |
CF260是染料在260 nm處的校正因子,用于消除染料對260 nm處的吸光度的影響(用于寡核苷酸和核酸標(biāo)記)
CF280是染料280 nm處的校正因子,用于消除染料對280 nm處的吸光度的影響(用于肽和蛋白質(zhì)標(biāo)記)
其他系列染料
我們的California Red™,Sunnyvale Red™和Helix Fluor™染料非常適合對寡核苷酸和肽進(jìn)行強(qiáng)大,高效的標(biāo)記。這些系列具有改進(jìn)的性能和亮度,仍然與傳統(tǒng)的熒光標(biāo)記染料(例如FAM,TET,VIC,JOE,NED,TAMRA和ROX)檢測平臺兼容。
其他熒光標(biāo)記系列染料:
| 貨號 | 產(chǎn)品名稱 | Ex(nm) | Em(nm) | 規(guī)格 |
| 250 | Helix Fluor™545,琥珀酰亞胺酯 | 525 | 545 | 1mg |
| 251 | Helix Fluor™575,琥珀酰亞胺酯 | 546 | 575 | 1mg |
| 394 | Sunnyvale Red™SE *替代6-ROX * | 576 | 605 | 5mg |
| 473 | California Red™ SE | 583 | 603 | 5mg |
| 479 | California Red™ SE | 583 | 603 | 1mg |
不用于熒光標(biāo)記的染料
蛋白酶參與許多生理過程, 蛋白酶的檢測和特定蛋白酶抑制劑的篩選對于發(fā)現(xiàn)用于治療和管理蛋白酶相關(guān)疾病的潛在藥物至關(guān)重要,各種供體和受體分子(熒光的或非熒光的)附著在肽/蛋白質(zhì)上(形成內(nèi)部淬滅的結(jié)合物),并根據(jù)氨基酸序列用于檢測蛋白酶。精心選擇供體和受體分子,使受體的激發(fā)波長與供體發(fā)射波長重疊,從而確保熒光通過共振能量轉(zhuǎn)移而淬滅,底物的酶水解導(dǎo)致供體和受體分子的空間分離,從而恢復(fù)供體熒光。
FRET原理
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種物理現(xiàn)象,在生物醫(yī)學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)中已經(jīng)越來越流行。FRET是能量從供體分子(donor)到受體分子(acceptor)的無熱量傳輸。供體分子是最初吸收能量的熒光基團(tuán),而受體是隨后轉(zhuǎn)移能量的熒光基團(tuán),這種共振相互作用發(fā)生在大于原子間的距離上,而沒有轉(zhuǎn)化為熱能并且沒有任何分子碰撞。能量轉(zhuǎn)移導(dǎo)致供體的熒光強(qiáng)度和激發(fā)態(tài)壽命的減少,以及受體的發(fā)射強(qiáng)度的增加。以發(fā)生FRET的方式相互作用的一對分子通常稱為供體/受體對。由于它對距離敏感,F(xiàn)RET被用于觀察分子間相互作用。

圖2. 從供體到受體分子的FRET過程圖。水平線代表每個分子的離散電子能級。能級被標(biāo)記為單峰態(tài)(S)或三重態(tài)(T),其下標(biāo)分別為0,1或2(分別代表基態(tài),第一激發(fā)態(tài)或第二激發(fā)態(tài))。分子的電子通常處于基態(tài)S0。電子可以通過許多過程被激發(fā)到更高的能級,包括光吸收和化學(xué)反應(yīng)。
盡管有很多影響FRET的因素,但要使FRET發(fā)生需要滿足的主要條件相對較少:
供體和受體分子必須彼此接近(通常為10-100Å)
受體的激發(fā)光譜必須與供體的發(fā)射光譜重疊。它們重疊的程度稱為光譜重疊積分(J)
供體和受體過渡偶極的方向必須近似平行
假設(shè)供體受體對是相匹配的,發(fā)生FRET所必需的最關(guān)鍵元素是供體受體對之間的緊密接近。Förster證明了過程(E)的效率取決于供體與受體之間距離的六次方的倒數(shù),如以下等式所示:
E = R o 6 /(R o 6 + r 6)
其中Ro是能量傳遞一半時的Förster距離,r是供體與受體之間的實(shí)際距離。Ro的大小取決于體與受體的光譜性質(zhì)。Förster距離在20到90Å之間時,對研究生物大分子最有用。
Tide Quencher™系列
盡管DABCYL已被用于開發(fā)各種FRET應(yīng)用,但對于較長波長的染料(例如熒光素,羅丹明和花青素)的淬滅效率較低,限制了其在敏感的熒光FRET探針開發(fā)中的應(yīng)用。另外,DABCYL的吸收光譜對環(huán)境敏感。我們已開發(fā)出耐用的Tide Quencher™受體染料,用于研發(fā)更長波長的FRET探針,Tide Quencher™染料是消除經(jīng)典淬滅劑限制的絕佳選擇。

Tide Quencher™染料的主要優(yōu)點(diǎn):
探索其他淬滅劑可能無法實(shí)現(xiàn)的FRET潛力
多種反應(yīng)形式便于自我構(gòu)建所需的FRET生物分子
與您所需的熒光供體完全匹配
性價比高
Tide Quencher™系列產(chǎn)品:
| 淬滅劑 | 激發(fā)(nm) | 消光系數(shù)(ε) | CF260 | CF280 |
| Tide Quencher™1 | 488 | 20,000 | 0.147 | 0.194 |
| Tide Quencher™2 | 512 | 21,000 | 0.100 | 0.120 |
| Tide Quencher™2WS | 515 | 21,000 | 0.100 | 0.120 |
| Tide Quencher™3 | 576 | 22,000 | 0.085 | 0.091 |
| Tide Quencher™3WS | 576 | 90,000 | 0.186 | 0.205 |
| Tide Quencher™4 | 604 | 23,000 | 0.146 | 0.183 |
| Tide Quencher™4WS | 604 | 90,000 | 0.149 | 0.136 |
| Tide Quencher™5 | 661 | 24,000 | 0.170 | 0.082 |
| Tide Quencher™5WS | 661 | 130,000 | 0.072 | 0.082 |
| Tide Quencher™6WS | 691 | 130,000 | 0.120 | 0.102 |
CF260是染料在260 nm處的校正因子,用于消除染料對260 nm處的吸光度的影響(用于寡核苷酸和核酸標(biāo)記)
CF280是染料280 nm處的校正因子,用于消除染料對280 nm處的吸光度的影響(用于肽和蛋白質(zhì)標(biāo)記)
作為一家具有高端的技術(shù)實(shí)力、先進(jìn)的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè),總部位于武漢光谷高新技術(shù)開發(fā)區(qū),服務(wù)面向全國。艾美捷科技是集進(jìn)口試劑、實(shí)驗(yàn)室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品、整合的解決方案,及優(yōu)質(zhì)的物流服務(wù)。為了更好的服務(wù)客戶,公司組建了一支經(jīng)驗(yàn)豐富的研發(fā)團(tuán)隊(duì)-艾美捷生物技術(shù)中心,進(jìn)入研發(fā)生產(chǎn)階段,將更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品推薦給國內(nèi)生物領(lǐng)域的同仁們!
艾美捷科技與國內(nèi)外優(yōu)秀的生物試劑供應(yīng)商優(yōu)保持著密切的合作關(guān)系,目前已成為眾多國際知名品牌的中國總代理或一級代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、ProSpec、Norgen Biotek、Mabtech、Matreya、iRegene、StressMarq、ImmunoReagents、SouthernBiotech、Origene、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短時間內(nèi)為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品及物流服務(wù)。
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