TECHNICAL COLUMN
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對于任何一種特定的靶抗原,都有不止一種有效抗體。為了縮小選擇范圍,實(shí)驗(yàn)中通常要考慮以下幾個方面:
1.分析或者應(yīng)用類型
2.樣品的性質(zhì)
3.樣品的種類
4.抗體宿主的種類
5.抗體的標(biāo)記和檢測
用途
抗體數(shù)據(jù)表所顯示的用途都是已經(jīng)得到檢測證明可以發(fā)揮作用的。如果某項用途沒有列出,并不意味著抗體不合適,而是還沒有檢測是否有該項用途或不知道抗體如何發(fā)揮作用。如果已經(jīng)檢測并證明無效也會在表中列出。
樣品的性質(zhì)
樣品的性質(zhì)會告訴您哪個抗體最合適,至少要考慮以下兩個方面:
1.要檢測的蛋白區(qū)域。刺激宿主動物產(chǎn)生抗體的具有免疫原性的物質(zhì)種類繁多,包括全長的蛋白、蛋白片段、多肽、整個生物機(jī)體(例如細(xì)菌)或細(xì)胞。免疫原通常在數(shù)據(jù)表中會有顯示(盡管在很多例子中由于專利原因找不到關(guān)于免疫原的詳細(xì)描述)。如果要檢測的是一個蛋白片段或全長蛋白的異構(gòu)體或特定區(qū)域,那就要求選擇的抗體是由該特異片段或區(qū)域或者包含該特異片段或區(qū)域的免疫原刺激產(chǎn)生的。如果要通過 FACS 去檢測活細(xì)胞表面蛋白,則要求選擇的抗體是由蛋白的細(xì)胞外區(qū)域刺激產(chǎn)生的。
2.樣品的處理工藝。有些抗體要求樣品先進(jìn)行特殊處理。例如,許多抗體只識別降解或變性蛋白,可能因?yàn)檫@樣會暴露藏在二次或三次折疊后蛋白內(nèi)部的抗原表位。另一方面,有些抗體僅識別自然折疊狀態(tài)蛋白上的表位。(Abcam 公司用于 western blotting 的抗體,樣品都需進(jìn)行降解和變性處理,除非在數(shù)據(jù)表中特殊標(biāo)明)。當(dāng)搜尋用于免疫組化的抗體時,則應(yīng)注意有些抗體只適合用于未固定冷凍組織。有時,抗原修復(fù)步驟則必不可少,這樣可以消除由福爾馬林固定所引起交聯(lián),因?yàn)橛行┛贵w不能結(jié)合福爾馬林固定和石蠟包埋組織中的靶目標(biāo)。在數(shù)據(jù)表的應(yīng)用章節(jié)會明確指出上述限制。
樣品種類
盡管由于具有足夠多的同源氨基酸序列,抗體可以和其它物種的同一靶蛋白反應(yīng),但是我們選擇的抗體仍然應(yīng)該是來源于同一物種的抗原刺激產(chǎn)生的。如果樣品不是來自于列表所示的物種之一,也不能說明該抗體不可以用來檢測這種樣品,而可能是來自該物種的樣品沒被檢測過,因此我們很難推薦它的適用性。根據(jù)序列相似性可以預(yù)測交叉反應(yīng)性:值得驕傲的是在數(shù)據(jù)列表里有 ExPASy 和 NCBIBLAST 的鏈接,可以比對不同物種來源氨基酸序列的同源性。
選擇一抗宿主的類別
一般來說,當(dāng)用標(biāo)記二抗來檢測非標(biāo)記一抗時,產(chǎn)生一抗的宿主動物的類別就非常重要。對于免疫組化,產(chǎn)生一抗的宿主應(yīng)盡可能的和樣品的宿主種類不同,以避免二抗的免疫球蛋白與樣品中內(nèi)在的免疫球蛋白發(fā)生潛在的交叉反應(yīng)。例如,用于檢測鼠源蛋白的一抗就不 應(yīng)來源于鼠或大鼠,來源于兔則是比較適合的選擇,接下來用檢測分子(酶、熒光、生物素等)標(biāo)記的抗兔 IgG 的二抗進(jìn)行結(jié)合。如果有已標(biāo)記的一抗則可以直接避免上述交叉反應(yīng)發(fā)生。對于不含內(nèi)源性免疫球蛋白樣品的檢測,宿主的種類選擇不用很嚴(yán)格。例如進(jìn)行western blotting 的細(xì)胞裂解液就被認(rèn)為不包含 IgG。而組織溶解液和組織培養(yǎng)上清(包括血清)則被認(rèn)為是含免疫球蛋白的。Westernblotting 時 IgG 會以 50 和 25kDa 的條帶出現(xiàn)在降解和變性樣品中,分別相當(dāng)于 IgG 分子的重鏈和輕鏈。
選擇二抗
二抗應(yīng)來源于抗一抗的物種。舉例來說,如果您的一抗來源于鼠,那么二抗就應(yīng)該選擇抗鼠的。我們建議仔細(xì)核對二抗數(shù)據(jù)表以確定您要使用的二抗。
Abcam提供有大量標(biāo)記各種熒光物質(zhì)和染色物質(zhì)的二抗。檢查您所用的一抗數(shù)據(jù)表的底部,將會顯示一些合適的二抗。為了找到您自己的二抗,可以使用我們的導(dǎo)航框或通過主頁中心的鏈接來選擇產(chǎn)品類型,然后選擇您一抗的種類,這樣會顯示大量適用于一抗種類的二抗。
雙重染色抗體的選擇
對細(xì)胞培養(yǎng)液或組織上清液進(jìn)行雙免疫染色要求非標(biāo)記一抗來源于不同物種的動物,而二抗則特異性識別其中一種一抗。二抗如果與其他動物來源的免疫球蛋白有交叉吸附,則會在數(shù)據(jù)表中明確說明。
熒光和染料標(biāo)簽
標(biāo)簽結(jié)合在抗體上使抗體的結(jié)合可見。標(biāo)簽的選擇依據(jù)以下幾個方面
1.檢測方法:熒光或有色沉淀。熒光標(biāo)簽會在特定波長的光激發(fā)下發(fā)光。根據(jù)它們自己激發(fā)和發(fā)光性質(zhì)不同,有一些熒光標(biāo)簽是可用的。在結(jié)合了合適的底物時,酶標(biāo)簽HRP和AP可以形成有色沉淀。
2.有效的封固劑(只限免疫組化):AEC、Fast Red、INT或是其它的水溶性染色劑均溶于酒精,因此要求使用水溶性封固劑。以上提到的其他有機(jī)物要想得到較好的折射率,最好使用有機(jī)封固劑封固。熒光素標(biāo)簽需要水溶性封固劑。膽藻素蛋白(藻青蛋白/藻紅蛋白)需要不加甘油的水溶性封固劑,否則會產(chǎn)生淬滅效應(yīng)。
3.生物素標(biāo)記的抗體對于信號的放大是很有效的,比如可應(yīng)用于親和素-生物素-酶或熒光復(fù)合物(通常縮寫為ABC試劑)或者親和素或鏈
霉親和素結(jié)合酶或熒光染料檢測法。
未純化抗體的建議稀釋和濃縮
未純化抗體在某一特定抗體濃度下會發(fā)生很顯著的變化。如果不清楚給定的未純化抗體樣品的濃度,就可以參考下面的“特殊范圍”作為估計的指導(dǎo)。
組織培養(yǎng)上清 | 腹水 | 全抗血清 | 純化的抗體 | |
WB/斑點(diǎn)雜交 | 1/100 | 1/1000 | 1/500 | 1μg/ml |
HC/ICC | 純度達(dá)到 1/10 | 1/100 | 1/50-1/100 | 5μg/ml |
EIA/ELISA | 1/1000 | 1/100000 | 1/500 | 0.1μg/ml |
FACS/流式細(xì)胞術(shù) | 1/100 | 1/1000 | 1/500 | 1μg/ml |
IP | 1/100 | 1/50-1/100 | 1-10 μg/ml | |
濃度估計 | 1-3 mg/ml | 5-10 mg/ml | 1-10 mg/ml |
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