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了解過Western印跡實驗得都知道PVDF膜和NC膜作為應(yīng)用中最常用的兩種類型的膜,那大家該如何選擇?各有什么特點?其中PVDF膜市面上常見的也有三種。這三種膜有何不同,分別適合哪些應(yīng)用呢?
Part 1:膜的選擇
蛋白印跡所使用的膜的類型可能影響下列因素:
? 蛋白質(zhì)結(jié)合能力
? 是否需要用醇預(yù)濕
? 開展多次剝離(stripping)和再生檢測(reprobing)實驗的能力
? 蛋白質(zhì)觀察
? 長期印跡保存
? 信噪比
聚偏二氟乙烯(PVDF)和硝酸纖維素是Western印跡應(yīng)用中最常用的兩種類型的膜。
與硝酸纖維素膜相比,電轉(zhuǎn)到PVDF膜上有許多優(yōu)點。PVDF膜可提供更好的蛋白質(zhì)截留率、物理強度和廣泛的化學兼容性(Pluskal等,1986)。其中更高的機械強度和出色的耐化學性讓PVDF膜成為免疫檢測中各種染色應(yīng)用和二次檢測的理想選擇。使用PVDF膜的另一個優(yōu)點是,單塊凝膠上的平行重復(fù)泳道可用于各種應(yīng)用中,如考馬斯藍染色,接著切割條帶進行N端測序,蛋白質(zhì)水解/肽段分離/內(nèi)部測序,以及免疫檢測(Kurien等,2003)。市售的硝酸纖維素膜的典型結(jié)合能力是80 – 100 μg/cm2,而PVDF膜的結(jié)合能力是100 – 200 μg/cm2。
在檢測血清中人免疫缺陷病毒(HIV)時直接比較PVDF和硝酸纖維素膜,結(jié)果表明,PVDF膜有著更好的總體HIV抗原截留率,并且有助于改善提高抗體對糖基化包膜抗原的檢測。硝酸纖維素膜和PVDF膜的特性比較詳見表1。
表1. PVDF和硝酸纖維素膜特性及應(yīng)用的比較。
特性/應(yīng)用 | 硝酸纖維素 | PVDF |
物理強度 | 差 | 好 |
蛋白質(zhì)結(jié)合能力 | 80 – 100 μg/cm2 | 100 – 300 μg/cm2 |
耐溶劑性 | 否 | 是 |
Western轉(zhuǎn)移 | 是 | 是 |
總蛋白染料 | 膠體金 | 膠體金 |
麗春紅 | 麗春紅 | |
氨基黑 | 氨基黑 | |
印度墨汁 | 印度墨汁 | |
Sypro? 印跡染料 | 考馬斯藍染料 | |
檢測 | 顯色 | 顯色 |
化學發(fā)光 | 化學發(fā)光 | |
熒光 | 熒光 | |
放射性 | 化學熒光 | |
放射性 | ||
雙印跡方法 | 否 | 是 |
快速免疫檢測 | 否 | 是 |
Western再次雜交 | 是 | 是 |
Edman測序 | 否 | 是 |
氨基酸分析 | 是 | 是 |
SDS存在下的結(jié)合 | 差 | 好 |
膜上消化或質(zhì)譜分析 | 否 | 是 |
直接MALDI-TOF MS分析 | 否 | 是 |
數(shù)據(jù)可存檔 | 否 | 是 |
PVDF轉(zhuǎn)印膜
常見的三種PVDF膜:0.45 μm P膜、0.2 μm PSQ膜、0.45 μmFL膜
0.45 μm P膜是一種通用的基質(zhì),適用于一般的免疫印跡應(yīng)用。
0.2 μm PSQ膜適用于蛋白質(zhì)測序和低分子量蛋白的免疫印跡。它有著更高的蛋白質(zhì)結(jié)合能力以及比0.45 μm膜更高的截留率。
0.45 μmFL膜是為熒光免疫檢測而開發(fā)的。它在多種激發(fā)和發(fā)射波長范圍內(nèi)的熒光背景都極低。
以下提供各種PVDF轉(zhuǎn)印膜的性質(zhì),詳見表2。
表2. PVDF轉(zhuǎn)印膜的性質(zhì)和應(yīng)用。
P轉(zhuǎn)印膜 | PSQ轉(zhuǎn)印膜 | FL轉(zhuǎn)印膜 | |
描述 | 為結(jié)合從各種凝膠基質(zhì)上轉(zhuǎn)移的蛋白質(zhì)而優(yōu)化 | 均一的孔徑結(jié)構(gòu)帶來分子量<20 kDa的蛋白質(zhì)的出色結(jié)合 | 為熒光免疫檢測應(yīng)用而優(yōu)化 |
組成 | PVDF | PVDF | PVDF |
孔徑大小 | 0.45 μm | 0.2 μm | 0.45 μm |
疏水性 | 疏水 | 疏水 | 疏水 |
應(yīng)用 | Western印跡 | 低分子量 | Western印跡 |
結(jié)合分析 | Western印跡 | 斑點/狹縫印跡 | |
氨基酸分析 | 氨基酸分析 | 熒光免疫檢測 | |
N端蛋白測序 | 質(zhì)譜分析 | ||
斑點/狹縫印跡 | N端蛋白測序 | ||
糖蛋白觀察 | |||
脂多糖分析 | |||
質(zhì)譜分析 | |||
檢測方法 | 顯色 | 顯色 | 熒光 |
化學熒光 | 熒光 | 顯色 | |
化學發(fā)光 | 化學熒光 | 化學熒光 | |
放射性 | 化學發(fā)光 | 化學發(fā)光 | |
放射性 | |||
蛋白質(zhì)結(jié)合能力 | 胰島素:160 μg/cm2 | 胰島素:262 μg/cm2 | 胰島素:155 μg/cm2 |
BSA:215 μg/cm2 | BSA:340 μg/cm2 | BSA:205 μg/cm2 | |
山羊IgG:294 μg/cm2 | 山羊IgG:448 μg/cm2 | 山羊IgG:300 μg/cm2 | |
兼容的可逆染料 | 透射法 | 透射法 | 透射法 |
麗春紅 | 麗春紅 | 麗春紅 | |
CPTS | CPTS | CPTS | |
甲苯胺藍 | 甲苯胺藍 | Sypro 印跡染料 | |
Sypro? 印跡染料 | Sypro 印跡染料 | ||
兼容的不可逆染料 | 考馬斯亮藍染料 | 考馬斯亮藍染料 | 考馬斯亮藍染料 |
氨基黑 | 氨基黑 | 氨基黑 | |
印度墨汁 | 印度墨汁 | ||
膠體金 | 膠體金 |
看以上介紹大家可根據(jù)實驗需求來選擇所需要的膜~
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