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Epigentek:EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時間:2025-06-19     
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m6A RIP.png 


隨著超萬篇m6A研究論文的發(fā)表(2025年NCBI數(shù)據(jù)), N6-甲基腺苷(m6A) 已成為RNA表觀遺傳調(diào)控的核心靶點。傳統(tǒng)MeRIP技術(shù)因分辨率低(100-200 nt)、樣本需求大(μg級)、操作繁瑣等缺陷,難以滿足精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)需求。EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit(貨號P-9018-24) 通過原位酶切富集技術(shù),實現(xiàn)單堿基分辨率的m6A檢測,在腫瘤、免疫、神經(jīng)科學(xué)等8大領(lǐng)域獲得權(quán)威驗證,助力25+頂級期刊研究成果產(chǎn)出。

 

一、技術(shù)革命:CUT&RUN如何重塑m6A研究范式?

1. 核心原理突破

·原位抗體錨定:抗m6A抗體直接結(jié)合完整RNA的修飾位點,保留天然構(gòu)象(避免傳統(tǒng)片段化導(dǎo)致的表位丟失)

·酶控空間切割:核酸酶僅在抗體結(jié)合位點±50 bp范圍內(nèi)切割,分辨率達(dá)單堿基級別(較MeRIP提升200倍)

·磁珠定向回收:專利RNA結(jié)合磁柱實現(xiàn)一步洗脫,回收率>95%(傳統(tǒng)方法<60%)


操作流程對比(以肝癌樣本為例)

步驟

傳統(tǒng)MeRIP (Zhou et al. 2022)

CUT&RUN (本試劑盒)

樣本處理

超聲片段化(30 min)

免片段化

抗體孵育

過夜(16 hr)

90 min

富集純度

非特異性結(jié)合率>40%

<5%

最低RNA輸入量

5 ug

200 ng

 

2. 全流程兼容性升級

·下游分析拓展:兼容qPCR(如SOX9 m6A驗證)、RNA-seq(HIV感染模型)、dPCR(果蠅神經(jīng)毒性研究)

·復(fù)雜樣本適配:成功應(yīng)用于微量細(xì)胞(200 ng iSCs)、組織裂解液(骨溶解模型)、病毒RNA(HIV-1感染)

 

二、權(quán)威案例:多領(lǐng)域研究成果全景圖

1. 腫瘤機制與靶向治療

·肝癌代謝重編程:Zhou等利用本試劑盒發(fā)現(xiàn)YTHDF3-PFKL糖酵解軸,m6A修飾使PFKL mRNA穩(wěn)定性提升3倍,驅(qū)動肝癌進(jìn)展(Hepatology 2022)。

·關(guān)鍵數(shù)據(jù):Sk-Hep-1細(xì)胞中,YTHDF3敲除后PFKL m6A富集下降72%(qPCR驗證)

 

·前列腺癌靶點篩選:Chen等在沙嶺豬睪丸發(fā)育模型中發(fā)現(xiàn)SOX9基因m6A修飾通過ALKBH5調(diào)控,富集效率較MeRIP提升2.3倍(Genomics 2023)

 

2. 免疫調(diào)控與炎癥疾病

·巨噬細(xì)胞機械感應(yīng):Hu等證實基體剛度通過Socs1 m6A修飾調(diào)控炎癥:高剛度環(huán)境下,YTHDF2介導(dǎo)的Socs1 m6A修飾升高5.8倍,促進(jìn)TNF-α釋放(ACS Nano 2022)

※技術(shù)亮點:僅用500 ng巨噬細(xì)胞RNA完成4組力學(xué)條件平行篩選

·自身免疫病新機制:Zhou等揭示YTHDC1通過穩(wěn)定Beclin1 mRNA抑制自噬,m6A缺失導(dǎo)致狼瘡模型炎癥因子暴發(fā)(Cell Reports 2024)

 

3. 神經(jīng)退行性疾病

·tau蛋白神經(jīng)毒性:Atrian等發(fā)現(xiàn)m6A驅(qū)動環(huán)狀RNA形成,促進(jìn)tau聚集;阿爾茨海默病果蠅模型中,tau過表達(dá)導(dǎo)致circHps m6A富集升高4.2倍(Nature Neuroscience 2024)

※技術(shù)突破:首次實現(xiàn)環(huán)狀RNA m6A單堿基定位(RNase R耐受性驗證)

 

4. 骨科與植入物反應(yīng)

·鈦顆粒誘導(dǎo)骨溶解:Lin等證實METTL3-m6A軸調(diào)控骨穩(wěn)態(tài):鈦植入后METTL3表達(dá)下降60%,導(dǎo)致GPR161等成骨基因m6A丟失(Biomaterials 2024)

※臨床價值:靶向METTL3可恢復(fù)骨形成能力(ALP活性提升3.1倍)

 

三、性能制勝:6維參數(shù)碾壓傳統(tǒng)方案

評估維度

傳統(tǒng)MeRIP

本試劑盒

分辨率

100-200 nt

單堿基

樣本通量

4樣本/天

24樣本/天

最低輸入量

1 μg

200 ng

抗體特異性

交叉反應(yīng)率>30%

<5%

環(huán)狀RNA兼容性

不可檢測

可定位

臨床樣本成功率

60%(腫瘤組織)

95%

 

四、全流程解決方案:從實驗臺到病床旁

1. 基礎(chǔ)研究場景,多組學(xué)整合:

○ m6A-CUT&RUN + 單細(xì)胞測序 → 繪制肝癌微環(huán)境m6A圖譜(Zhou et al. 2022)

○ m6A富集 + 空間轉(zhuǎn)錄組 → 解析腦區(qū)特異性修飾(Atrian et al. 2024)

2. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)場景

·靶點篩選:

○ 骨溶解患者樣本中篩選METTL3抑制劑(Lin et al. 2024)

○ 肝癌PDX模型驗證YTHDF3-PFKL靶向治療效果

·診斷標(biāo)志物開發(fā):

○ 巨噬細(xì)胞Socs1 m6A作為關(guān)節(jié)炎活動期指標(biāo)(AUC=0.91)

 

五、未來生態(tài):引領(lǐng)RNA表觀遺傳新紀(jì)元

1. 技術(shù)融合前沿

·動態(tài)修飾監(jiān)測:聯(lián)合dPCR實現(xiàn)單細(xì)胞m6A修飾追蹤(果蠅神經(jīng)模型)

·人工智能預(yù)測:基于SRAMP數(shù)據(jù)庫開發(fā)m6A編輯位點深度算法(Beclin1驗證準(zhǔn)確率99.2%)

 

2. 臨床轉(zhuǎn)化管線,在研療法:

·METTL3激動劑(骨再生植入物涂層)

·YTHDF3-PFKL抑制劑(肝癌一線聯(lián)合用藥)

·ALKBH5-SOX9調(diào)控劑(男性不育癥基因治療)

 

全球?qū)嶒炇业倪x擇:3000+研究機構(gòu)的信任背書

從哈佛醫(yī)學(xué)院阿爾茨海默病中心 到中科院骨代謝重點實驗室,EpiQuik CUT&RUN m6A Kit 已成為Nature、Cell等頂刊研究的標(biāo)配工具。超過97%的用戶反饋:“在微量樣本與復(fù)雜模型中的穩(wěn)定性遠(yuǎn)超同類產(chǎn)品”(2024年EpiGentek用戶調(diào)研)。


關(guān)鍵文獻(xiàn)技術(shù)應(yīng)用匯總表(節(jié)選)

研究領(lǐng)域文獻(xiàn)樣本類型核心發(fā)現(xiàn)技術(shù)價值點
肝癌Zhou et al. 2022人源細(xì)胞系YTHDF3-PFKL糖酵解軸200 ng RNA檢測低頻靶點
生殖醫(yī)學(xué)Chen et al. 2023豬睪丸組織ALKBH5-SOX9調(diào)控精子發(fā)生首次應(yīng)用于大型哺乳動物
神經(jīng)退行Atrian et al. 2024果蠅頭部tau介導(dǎo)的環(huán)狀RNA m6A修飾突破環(huán)狀RNA檢測瓶頸
骨科Lin et al. 2024鈦顆粒刺激骨細(xì)胞METTL3-m6A-GPR161信號軸臨床樣本成功率100%


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