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解碼細胞守護者:泛素-蛋白酶體途徑中的去泛素化酶家族與生命科學探索

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時間:2024-03-26     
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背景

泛素-蛋白酶體途徑(ubiquitin-proteasome pathway,UPP)是細胞內主要的蛋白質降解系統(tǒng)之一,對于維持細胞內蛋白質穩(wěn)態(tài)和調控多種生物學過程至關重要。通過對底物蛋白的多聚泛素化并經(jīng)蛋白酶體降解,可以影響或調節(jié)多種細胞活動,包括:基因轉錄、細胞周期調節(jié)、免疫反應、細胞受體功能及腫瘤生長、炎癥過程等。該途徑也是一種動態(tài)的蛋白質雙向修飾調控系統(tǒng),在體內由泛素連接酶系統(tǒng)(E1-E2-E3)對底物進行泛素化修飾,去泛素化酶(DUB)家族負責通過水解泛素羧基末端的酯鍵、肽鍵或異肽鍵,將泛素分子特異性的從鏈接有泛素的蛋白質或者前體蛋白水解下來,起到去泛素化的作用,對蛋白降解進行反向調節(jié),從而影響蛋白質的功能。


UPP.png

 

泛素-蛋白酶體途徑中的去泛素化酶(DUBs)主要分為幾個大的家族,每個家族成員都有其特定的結構特征和生物學功能。以下是DUBs的主要家族成員:

泛素特異性蛋白酶(USPs):這是zui大的DUB家族,包含超過50個成員。USPs通常具有一個或多個USP結構域,這些結構域包含一個保守的催化三聯(lián)體,負責去泛素化活性。

卵巢腫瘤蛋白酶(OTUs):OTU家族成員較少,通過晶體結構分析發(fā)現(xiàn)這類蛋白酶雖然在氨基酸序列上與其他家族的去泛素化酶不同,但也具有三聯(lián)催化活性位點(Cys,His,Asp)組成的核心結構域,與UBP家族蛋白有很大相似性,并且已證明能起到去泛素化的作用。

泛素羧基末端水解酶(UCHs):UCH家族成員相對較少,它們專門作用于泛素的C末端,去除泛素鏈末端的單個泛素。

MJD去泛素化酶家族:Machado-Joseph疾病相關蛋白Ataxin-3被研究得較為清楚,它是個與神經(jīng)退化紊亂相關的蛋白。人類的Josephin家族蛋白有4個,它們的結構類似于UCH去泛素化酶家族,分別是Ataxin-3、Ataxin-3L、Josephin-1和Josephin2。    

JAMM蛋白酶家族:這一類去泛素化酶的代表是POH1,酵母細胞中的同源物稱為Rpn 11。這是一類能結合泛素化蛋白上泛素分子的金屬蛋白酶,具有MPN序列,或稱JAMM(Jab1/MPN domain associated metalloisopeptidase,Jab 1/MPN域相關金屬異肽酶)序列。這一序列含有較為保守的兩個組氟酸殘基和一個天冬氯酸殘基,它們與二價鋅離子共同構成催化中心。

這些家族成員通過去泛素化作用,對蛋白質的穩(wěn)定性、信號傳導、細胞周期、基因表達等多種細胞過程進行精細調控。DUBs的活性和調控機制的研究對于理解細胞內蛋白質穩(wěn)態(tài)和疾病發(fā)生具有重要意義。

 

艾美捷作為LifeSensors在中國的區(qū)域獨家代理,為您推薦LifeSensors品牌的DUBs系列產品,助你發(fā)表多篇高分文章。

 

貨號

名稱

蛋白大小

產品說明

DB101

UCH-L3

25kDa

屬于半胱氨酸蛋白酶,可識別并水解泛素或NEDD8的C末端甘氨酸上的肽鍵。(可裂解Ub-AMC, Ub-Rhodamine 110以及多種泛素修飾的多肽;對雙泛素底物沒有活性)

DB102

UCH-L5

49kDa

UCH-L5是26S蛋白酶體中19S復合物中的一個去泛素化酶/異肽酶,可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB103

BAP1

82kDa

通過介導組蛋白H2A和HCFC1的去泛素化在染色質中起關鍵作用, 它充當細胞生長的調節(jié)劑。可用于裂解Ub-AMC。

DB104

UCH-L1

25kDa

它對神經(jīng)元以及彌散神經(jīng)內分泌系統(tǒng)的細胞及其腫瘤具有高度特異性,占大腦總蛋白的> 1%,但其他組織幾乎不存在。可用于裂解Ub-AMC。

DB513

USP15

121kDa

與COP9信號復合體相關,參與調節(jié)多種信號通路,例如TGF-β受體信號傳導,NFκB和RNF41 / NRDP1-PRKN信號通路。可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB503

USP8core

46kDa

已證明USP8在受體酪氨酸激酶的穩(wěn)定性中起關鍵作用,USP8core只包含USP8蛋白的核心結構域。可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB510

USP47

157kDa

使單泛素化的DNA聚合酶β(POLB)去泛素化,穩(wěn)定POLB,從而在堿基切除修復(BER)中發(fā)揮作用。可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB530

USP30

51 kDa

去泛素化酶家族中的一員,主要定位在線粒體外膜,是一種半胱氨酸蛋白酶。研究表明USP30參與了細胞內線粒體形態(tài)的調控。后續(xù)研究發(fā)現(xiàn)USP30可以使PARK2以及PINK1驅動的線粒體自噬被逆轉。USP30作為去泛素化酶可以去除泛素標簽從而抑制線粒體自噬。USP30對磷酸化泛素的裂解效率較低。

DB201

OTUB1

32 kDa

可在體外切割K48和K63連接的泛素鏈。

DB202

YOD1

38 kDa

可裂解Ub-AMC

DB206

OTULIN

40.6 kDa

對線性泛素鏈(M1)具有高特異性,與HOIP(RNF31)結合,并調節(jié)其活性,從而影響NFκB調節(jié)的途徑和促炎反應。

DB209

A20

100 kDa

同時包含泛素連接酶和去泛素酶活性,可在體外裂解K11,K48和K63連接的泛素鏈,在NF-κB信號傳導和炎癥反應中起重要作用。





DB401

Ataxin-3

41kDa

在體外裂解K48連接的泛素鏈

DB403

JOSD1

22kDa

可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB404

JOSD2

22kDa

裂解K63連接的泛素鏈,對K48連接的泛素鏈裂解效率較低。可以在Ub-CHOP報告系統(tǒng)中發(fā)揮酶活。

DB301

AMSH

49 kDa

體外裂解K63連接的泛素鏈

DB302

MSHcore

20.5 kDa

體外裂解K63連接的泛素鏈

 

LifeSensors成立于1996年,位于美國賓夕法尼亞州費城,是一家為藥物發(fā)現(xiàn)與研究提供方法和可行性技術方法的生物技術公司,目前主要的產品有400多種,其產品主要覆蓋泛素和泛素蛋白酶體通路等科學應用領域,并且公司擁有兩大獨家技術平臺:用于細胞信號和藥物發(fā)現(xiàn)的泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS),以及增強目的蛋白在大腸桿菌、酵母、昆蟲和哺乳動物細胞中表達與純化的SUMO融合表達系統(tǒng),此外,LifeSensors還為泛素的蛋白質組學提供眾多定制技術服務,并且已經(jīng)開發(fā)了各種各樣的測定細胞中的生理底物或生物標志物的方法。

艾美捷作為LifeSensors在中國的區(qū)域獨家代理,艾美捷科技有限公司將為中國客戶提供全面的LifeSensors的產品。


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