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通過(guò)組蛋白后翻譯修飾(PTMs)進(jìn)行的表觀遺傳調(diào)控是基因表達(dá)控制的基石。這些修飾包括乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化,其動(dòng)態(tài)和可逆的特性影響著細(xì)胞功能和生物過(guò)程。為了闡明組蛋白PTMs在健康和疾病中的深遠(yuǎn)意義,對(duì)其定量的穩(wěn)健質(zhì)量方法是不可或缺的。

組蛋白PTM定量是基礎(chǔ)科學(xué)的重要組成部分,有助于揭示這些表觀遺傳標(biāo)記在胚胎發(fā)育和組織分化等正常生理活動(dòng)中的動(dòng)態(tài)變化。研究這些修飾為理解例如指導(dǎo)譜系承諾和器官形成的調(diào)控機(jī)制,或表觀遺傳學(xué)在組織特異性基因表達(dá)程序中的作用提供了重要見(jiàn)解。在疾病研究中,定量組蛋白PTMs對(duì)于破譯改變的表觀遺傳景觀至關(guān)重要。這種方法通過(guò)識(shí)別與不同疾病亞型相關(guān)的特定修飾特征,為診斷策略做出了貢獻(xiàn)。此外,理解疾病的表觀遺傳基礎(chǔ)有助于識(shí)別潛在的治療靶點(diǎn),為個(gè)性化治療策略鋪平了道路。組蛋白PTM定量在藥物發(fā)現(xiàn)工作中也發(fā)揮著關(guān)鍵作用,特別是在篩選調(diào)節(jié)這些表觀遺傳標(biāo)記的小分子方面。識(shí)別影響組蛋白PTMs的化合物為癌癥和神經(jīng)性疾病等各種疾病提供了潛在的治療途徑。其應(yīng)用還擴(kuò)展到表觀遺傳靶向療法的發(fā)展。
組蛋白PTM定量的方法有多種。染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)是用于此目的的基礎(chǔ)方法,采用選擇性免疫沉淀策略。該技術(shù)包括將蛋白質(zhì)與DNA交聯(lián),將染色質(zhì)片段化,并使用特定抗體沉淀帶有感興趣修飾的組蛋白。交聯(lián)逆轉(zhuǎn)后,可以通過(guò)PCR或下一代測(cè)序分析富集的DNA。ChIP允許將組蛋白PTMs映射到特定的基因組位點(diǎn),從而提供其空間分布的見(jiàn)解。質(zhì)譜(MS)是識(shí)別和定量組蛋白PTMs的多功能替代方法。它涉及從細(xì)胞或組織中提取組蛋白,進(jìn)行酶解,并通過(guò)質(zhì)譜分析產(chǎn)生的肽段。MS允許同時(shí)分析多種組蛋白PTMs,提供表觀遺傳景觀的全面概述。酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA)為組蛋白PTM定量提供了一種高通量的手段,依賴于抗體與修飾組蛋白的特異性結(jié)合。在典型的ELISA中,將樣品中的組蛋白固定在固相上,然后用特定抗體進(jìn)行檢測(cè)。ELISA特別適合于在各種生物樣本中大規(guī)模篩選組蛋白PTM水平。
盡管取得了一定進(jìn)展,但組蛋白PTM定量方法中仍存在一些影響結(jié)果準(zhǔn)確性和可靠性的缺點(diǎn)。主要挑戰(zhàn)之一是確保抗體的特異性和靈敏度。結(jié)果的準(zhǔn)確性取決于抗體對(duì)感興趣修飾的選擇性。某些修飾的經(jīng)驗(yàn)證抗體的可用性有限,需要持續(xù)進(jìn)行抗體表征和驗(yàn)證工作。確保數(shù)據(jù)可重復(fù)性是組蛋白PTM定量中的另一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題。標(biāo)準(zhǔn)化操作和分析流程對(duì)于減少實(shí)驗(yàn)室間差異并增強(qiáng)不同研究結(jié)果的可比性至關(guān)重要。實(shí)驗(yàn)程序中的背景噪聲以及需要強(qiáng)大的歸一化策略來(lái)考慮實(shí)驗(yàn)條件的變化也是重要的考慮因素。在動(dòng)態(tài)細(xì)胞狀態(tài)下實(shí)現(xiàn)精確定量,需要開(kāi)發(fā)標(biāo)準(zhǔn)化的歸一化實(shí)踐。
為解決這些問(wèn)題,表觀遺傳學(xué)專(zhuān)家EpigenTek設(shè)計(jì)了一系列高靈敏度、特異性、可靠且一致的組蛋白PTM定量試劑盒。通過(guò)組蛋白H3修飾多重分析試劑盒(貨號(hào)P-3100)和組蛋白H4修飾多重分析試劑盒(貨號(hào)P-3102),可以在同一個(gè)微孔板上,使用快速高效的類(lèi)似ELISA方法,同時(shí)篩選和檢測(cè)21種不同的組蛋白H3 PTMs或10種不同的組蛋白H4 PTMs,這些修飾包括所有最重要且經(jīng)過(guò)充分表征的模式。這些創(chuàng)新的比色法測(cè)定具有高靈敏度和低檢測(cè)閾值,并且無(wú)需電泳、色譜或昂貴設(shè)備。
貨號(hào) | ||
英文名稱(chēng) | EpiQuik Histone H3 Modification Multiplex Assay Kit (Colorimetric) | EpiQuik Histone H4 Modification Multiplex Assay Kit (Colorimetric) |
中文名稱(chēng) | 組蛋白H3修飾多重分析試劑盒 | 組蛋白H4修飾多重分析試劑盒 |
用途 | 同時(shí)檢測(cè)21種不同的組蛋白H3修飾,包括H3K4me1,H3K4me2,H3K4me3,H3K9me1,H3K9me2,H3K9me3,H3K27me1,H3K27me2,H3K27me3,H3K36me1,H3K36me2,H3K36me3,H3K79me1,H3K79me2,H3K79me3,H3K9ac,H3K14ac,H3K56ac,H3ser10P,H3ser28P,H3K18ac,總H3 | 同時(shí)檢測(cè)10種不同的組蛋白H4修飾,包括H4K5ac,H4K8ac,H4K12ac,H4K16ac,H4K20m1,H4K20m2,H4K20m3,H4R3m2a,H4R3m2s,H4ser1,總H4 |
數(shù)據(jù) |
使用總組蛋白提取試劑盒(貨號(hào)OP-0006)從MCF-7和MDA-231細(xì)胞中制備組蛋白提取物,使用組蛋白H3修飾多重檢測(cè)試劑盒(貨號(hào)P-3100)檢測(cè)21組組蛋白H3修飾。 |
使用總組蛋白提取試劑盒(貨號(hào)OP-0006)從MCF-7和MDA-231細(xì)胞中制備組蛋白提取物,使用組蛋白H4修飾多重檢測(cè)試劑盒(貨號(hào)P-3102)檢測(cè)10種組蛋白H4修飾。 |
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