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特色產品DNA損傷是細胞在環(huán)境因素(如紫外線、化學誘變劑)及自身正常代謝過程(如氧化呼吸鏈產生的活性氧)共同作用下持續(xù)發(fā)生的分子事件。據(jù)統(tǒng)計,每個細胞每天約發(fā)生1000至100萬次DNA損傷事件。雖然這一數(shù)字相對于人類基因組約60億個堿基的總量而言占比甚微,但若關鍵基因上的損傷未能被及時正確修復,將阻礙細胞正常功能,并顯著增加癌變風險。
目前已有多種方法用于檢測DNA損傷,其中彗星檢測(單細胞凝膠電泳)是應用最廣泛的技術之一。在電場作用下,受損DNA(含碎片和鏈斷裂)與完整DNA分離,在顯微鏡下呈現(xiàn)經(jīng)典的“彗星拖尾”形態(tài)。然而,Sestili和Cantoni(參考文獻1)開發(fā)了一種新型單細胞檢測技術——堿性暈圈法。該方法無需電泳步驟,而是利用損傷DNA片段在堿性低滲緩沖液中通過瓊脂糖凝膠孔徑的徑向擴散,且擴散距離與DNA片段大小呈反比。“暈圈”一詞描述了損傷DNA從分離的細胞核中徑向擴散后形成的形態(tài)。
與彗星檢測相比,堿性暈圈法具有操作更簡單、更快速的優(yōu)點(盡管彗星檢測在靈敏度上仍略勝一籌)。艾美捷代理Cell Biolabs公司推出的OxiSelect堿性暈圈檢測試劑盒(貨號:STA-890)是一種快速、靈敏的細胞DNA損傷檢測方案,每套試劑盒可完成15次檢測。
一、檢測原理
OxiSelect堿性暈圈檢測試劑盒是一種基于單細胞水平的DNA損傷檢測方法,其原理與操作流程如下:
1. 細胞包埋:將待測單細胞懸液與熔融的暈圈專用瓊脂糖按比例混合,迅速加樣至OxiSelect暈圈檢測專用玻片(3孔規(guī)格)的各孔中,4℃凝固,使細胞固定于瓊脂糖凝膠微環(huán)境內。
2. 裂解與堿性擴散處理:包埋后的細胞加入暈圈擴散緩沖液和堿性溶液進行處理。該緩沖液為低滲堿性體系,可破壞細胞膜和核膜,釋放出細胞核;同時,堿性條件使DNA雙鏈解旋變性,并將DNA鏈斷裂轉化為可遷移的單鏈缺口。在此條件下,受損DNA片段因其分子量較小,能夠通過瓊脂糖凝膠的孔隙發(fā)生滲透性徑向擴散;而完整DNA由于分子量大、超螺旋結構復雜,擴散能力極弱。
3. 暈圈形成與觀察:經(jīng)過堿性擴散處理后,損傷DNA從細胞核中心向四周擴散,形成環(huán)形的“暈圈”形態(tài)(見圖1)。用Vista Green DNA染料染色后,在熒光顯微鏡下可清晰觀察到:未損傷細胞核呈致密的圓形熒光點,無暈圈或暈圈極窄;損傷程度越高的細胞,暈圈直徑越大,邊緣熒光越彌散。
4. 結果量化:通過計算核擴散因子對每個樣本的DNA損傷程度進行定量。核擴散因子的計算方法通常為:(暈圈直徑)/(核直徑),或通過圖像分析軟件測量暈圈面積與核面積的比值。建議每個樣本至少分析50個細胞。
二、試劑盒組分與儲存
試劑盒在室溫下運輸,各組分及儲存要求如下:
組分名稱 | 貨號 | 規(guī)格 | 儲存條件
3孔堿性暈圈檢測專用玻片 | STA-892 | 5塊(共15孔) | 室溫
暈圈瓊脂糖(無菌) | 289001 | 15 mL瓶 | 室溫
10×暈圈擴散緩沖液 | 289002 | 20 mL瓶 | 室溫
EDTA溶液(500 mM) | 235004 | 50 mL瓶 | 室溫
10×暈圈堿性溶液 | 289003 | 20 mL瓶 | 室溫
Vista Green DNA染料(10000×) | 235003 | 5 uL管 | -20℃ |
儲存注意事項:收到試劑盒后,Vista Green DNA染料應立即轉移至-20℃保存;其他所有組分室溫保存即可。染液應避免反復凍融,長期不用時建議分裝保存。
三、操作流程要點
1. 細胞準備:收集待測細胞(推薦密度為1-5×105 cells/mL),用不含Mg2+和Ca2+的PBS洗滌一次。
2. 包埋:將細胞懸液與37℃預熱的暈圈瓊脂糖按1:10(體積比)混合,立即吸取50-100 uL滴加至玻片各孔中,4℃凝固10分鐘。
3. 裂解與擴散:每孔加入預冷的1×暈圈擴散緩沖液(含堿性溶液),4℃孵育20-30分鐘。
4. 中和與固定:用去離子水輕輕洗滌玻片,再用70%乙醇固定5分鐘。
5. 染色:加入1×Vista Green DNA染液,室溫避光染色15分鐘。
6. 觀察與分析:在熒光顯微鏡下(激發(fā)波長約490 nm,發(fā)射波長約520 nm)觀察并采集圖像。使用圖像分析軟件測量核直徑和暈圈直徑,計算核擴散因子。
四、結果示例


圖: H2O2處理293細胞。在進行堿性鹵素試驗前,293細胞未處理(上圖)或用1mM H2O2處理30分鐘
五、相關產品
OxiSelect 氧化性DNA損傷ELISA試劑盒 | STA-320 | 8-OHdG定量
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六、注意事項
1. 操作簡便性:堿性暈圈法的最大優(yōu)勢在于無需電泳設備,僅需常規(guī)水浴、冰箱和熒光顯微鏡即可完成,適合實驗室條件有限或需要快速初篩的場景。
2. 靈敏度對比:雖然堿性暈圈法操作更簡便,但彗星檢測對低水平DNA損傷的靈敏度更高。對于需要高靈敏度的研究,建議優(yōu)先考慮彗星檢測;對于藥物篩選等需要高通量、快速比較的實驗,堿性暈圈法是理想選擇。
3. 染色保護:Vista Green DNA染料為光敏性物質,染色后應盡快在熒光顯微鏡下觀察和拍照,避免長時間光照導致熒光淬滅。
4. 瓊脂糖溫度控制:瓊脂糖與細胞混合前必須冷卻至37℃左右,溫度過高會導致細胞熱損傷,溫度過低則瓊脂糖提前凝固,無法均勻包埋。
5. 緩沖液新鮮配制:堿性擴散緩沖液應現(xiàn)用現(xiàn)配,長時間放置會導致pH漂移,影響DNA解旋效率。
文獻參考:
1. Sestili P., and Cantoni O. (1999) Free Radic. Biol. Med. 26, 1019-1026.
2. Ostling, O., and Johanson, K. J. (1984). Biochem. Biophys. Res. Commun. 123, 291–298.
3. Sestili P., Martinelli C., and Stocchi V.? (2006) Mutat Res 607, 205–214.
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