歷數(shù)近兩年來的新聞熱點，SARS-CoV-2（新冠病毒）作為一種導致 COVID-19（新冠肺炎）的RNA病毒，持續(xù)受到各國學者和企業(yè)的關(guān)注，吸引了全球人民的目光。各國對新冠疫苗的研發(fā)可謂不遺余力。在我國，進入臨床階段的新冠疫苗就不下5種。

什么是SARS-CoV-2?

SARS-CoV-2（新冠病毒）是由一個長度超過29,000 個核苷酸的正向單鏈RNA基因組和 4 種不同類型的結(jié)構(gòu)蛋白組成。冠狀病毒等正鏈RNA病毒的基因組可以充當mRNA，并在宿主細胞內(nèi)直接翻譯成蛋白質(zhì)。負鏈RNA中間體也由冠狀病毒產(chǎn)生，用作基因組RNA的正鏈合成的模板，然后由結(jié)構(gòu)蛋白包裝，以完成病毒粒子后代的組裝和亞基因組RNA的轉(zhuǎn)錄。

在 SARS-CoV-2 基因組的組成序列中已經(jīng)區(qū)分了部分開放閱讀框 (ORF)，對應于病毒結(jié)構(gòu)元件（N、S、E 和 M 蛋白）和輔助基因。核衣殼蛋白（N蛋白，Nucleocapsid）包裹著基因組，而 S蛋白（刺突蛋白，Spike protein）、E蛋白（包膜蛋白，Envelope protein）和 M蛋白（膜蛋白，Membrane protein）構(gòu)成了周圍的脂雙層包膜。而S蛋白，它通過宿主ACE-2 受體識別和膜融合，使病毒感染成為可能。據(jù)報道，冠狀病毒中 5' 端的 ORF，ORF 1a/1b（又名復制酶/轉(zhuǎn)錄酶基因）可編碼用于病毒 RNA合成和其他非結(jié)構(gòu)蛋白 (nsps)（例如poly(A) 拖尾）的聚合酶。

RNAm6A甲基化如何在SARS-CoV-2中發(fā)揮作用？

對腺苷甲基化的繼續(xù)研究，闡明病毒生命周期調(diào)節(jié)的動態(tài)，將促進新冠病毒疫苗的設(shè)計和開發(fā)。N6-甲基腺苷或 m6A 是最常見和最豐富的真核 RNA修飾。它占所有 RNA甲基化的 80%以上，幾乎影響核糖核酸生物學的各個方面：結(jié)構(gòu)、剪接、定位、翻譯、穩(wěn)定性和代謝。有趣的是，m6A 表現(xiàn)出促病毒和抗病毒活性，這取決于病毒種類和宿主細胞類型。

SARS-CoV-2 的 RNA基因組包含50多個潛在的m6A位點，這些位點基于RNA甲基化酶復合物METTL3/14對m6A修飾的特定序列基序而存在，包括 GGACU(T)、GGACA 和 GGACC。因此，SARS-CoV-2 RNA中超過0.64%的腺苷，或0.18%的所有堿基，可能是m6A。m6A 的增加或缺失可導致RNA病毒的顯著功能變化，改變宿主細胞融合/進入、復制、傳播、病原體強度和免疫缺陷。宿主細胞的 m6A 表觀轉(zhuǎn)錄組在宿主抵抗中發(fā)揮作用，在病毒感染后也會發(fā)生改變。因此，對病毒和宿主RNAm6A甲基化修飾的研究可能會揭示影響 SARS-CoV-2 感染的因素，對治療新冠肺炎提供新的思路。

如何研究 SARS-CoV-2 的RNAm6A甲基化修飾？

從細胞、組織或者病毒樣本開始，到最下游的文庫建立和NGSm6ARNA基因位點的鑒定，對SARS-CoV-2 的RNA m6A甲基化的研究是一個龐大而系統(tǒng)的工程。中間涉及包括定量 ELISA、酶活性/抑制測定和高度特異性的抗體等等，這里大致列舉了一個工作流程圖。

具體可能用到的產(chǎn)品工具如下：

進一步了解研究的細節(jié)，可參考艾美捷的上一篇文章：全套病毒RNA m6A甲基化修飾研究工具來了！

【參考文獻】

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