TECHNICAL COLUMN
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一、目的基因的克隆(以pshuttl-CMV質(zhì)粒為例)
1.選擇適當(dāng)酶切位點(diǎn),進(jìn)行酶切連接,將目的片段插入 pshuttl-CMV 質(zhì)粒多克隆位點(diǎn)。
2. 重組質(zhì)粒鑒定: 酶切鑒定或測(cè)序。
3. 重組質(zhì)粒擴(kuò)增,純化并準(zhǔn)備適量含目的基因的穿梭質(zhì)粒。
4. 用 PmeI 單酶切線性化重組穿梭質(zhì)粒,電泳鑒定質(zhì)粒完全被切開。
5. 膠回收線性化質(zhì)粒,以備共轉(zhuǎn)化使用。
二、共轉(zhuǎn)化
1、大腸桿菌 BJ5183 電轉(zhuǎn)感受態(tài)制備
從新鮮瓊脂板上挑取單個(gè) BJ5183 細(xì)菌,接種于 LB 培養(yǎng)基中,37℃振搖過夜 。接種 25ml 過夜培養(yǎng)物于 500ml LB 培養(yǎng)基,37℃振搖,至 OD600 達(dá)到 0.4。迅速將培養(yǎng)物置于冰浴中 30min,至充分冷卻。將菌液轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的離心管中,4℃下以 2500r/min 離心 15 min,棄培養(yǎng)液,回收細(xì)胞。以 10ml 預(yù)冷的 10%甘油洗滌沉淀,低溫離心,共兩次。加約 1ml(適量)預(yù)冷的 10%甘油重懸沉淀,稀釋懸液 100 倍,測(cè)量 OD600 ,至稀釋濃度為 2-3×1010 個(gè)細(xì)胞/ ml (1.0 OD600 約 2.5×1010 個(gè)細(xì)胞/ml)。分裝,-80℃或液氮保存待用。
2、病毒骨架質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌,擴(kuò)增,純化。
3、將 1-5?l (約 1?g) 線性化的穿梭質(zhì)粒及 1?l(約 100ng/?l)病毒骨架質(zhì)粒(如pAdEasy-1)加入至含約 40?l BJ5183 電轉(zhuǎn)感受態(tài)的 EP 管中混勻,冰上冷卻。
4、將混合物加入電轉(zhuǎn)杯,電擊(1250-1500V/mm,5ms)。
5、電擊結(jié)束取出樣品,加入 1ml SOC 或 LB 培養(yǎng)液,37℃低速振蕩 40min。
6、取適當(dāng)體積的電擊轉(zhuǎn)化細(xì)胞液涂于數(shù)個(gè)卡那霉素抗性平板(25-50mg/ml),37℃培養(yǎng) 16-20hr。
7、次日挑取平板上長(zhǎng)出的菌落(選擇最小的菌落),接種于 3ml 含 25-50mg/ml的 LB 培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng) 10-15hr。
8、堿裂法提取質(zhì)粒,0.8%瓊脂糖凝膠電泳篩選,大質(zhì)粒為可能陽(yáng)性克隆,進(jìn)一步酶切鑒定。以 PacI 單酶切,0.8%瓊脂糖凝膠電泳如顯示出一條大片段(約30kb),及一條小片段(約 3.0 或 4.5kb)(同時(shí)可進(jìn)行其它酶切鑒定),則基本確定為陽(yáng)性克隆。
9、取1-5?l 陽(yáng)性質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至DH5α大腸桿菌細(xì)胞(BJ5183為recA+,質(zhì)粒DNA易發(fā)生突變,DH5α或JM109,XL1-blue菌株為重組缺陷性菌株,可穩(wěn)定擴(kuò)增已鑒定的重組質(zhì)粒),擴(kuò)增細(xì)菌并純化質(zhì)粒。
三、重組病毒質(zhì)粒轉(zhuǎn)導(dǎo)293細(xì)胞
1、293細(xì)胞培養(yǎng):轉(zhuǎn)導(dǎo)24小時(shí)前,以方瓶為例,接種2×106293細(xì)胞于25cm2方瓶,使生長(zhǎng)密度約50-70%。(也可以使用6孔或96孔板)
2、以PacI單酶切重組病毒質(zhì)粒(轉(zhuǎn)導(dǎo)25cm2方瓶約需4?gDNA),完全線性化后,乙醇沉淀,再以20 ?l ddH2O溶解。
3、脂質(zhì)體包裹質(zhì)粒(以Lipofectamine為例):每4?g PacI約需20?l Lipofectamine包裹.質(zhì)粒及脂質(zhì)體分別稀釋于500?l無血清培養(yǎng)基再混合,置于室溫下15-30min。
4、以無血清培養(yǎng)基輕輕洗滌培養(yǎng)瓶,另加2.5ml無血清培養(yǎng)基,37℃放置10min。
5、將Lipofectamine-DNA混合物加入培養(yǎng)瓶,37℃孵箱放置4hr。
6、4hr后,棄Lipofectamine-DNA混合液,另加入6ml DMEM完全培養(yǎng)基(含10%FCS)。如有大量細(xì)胞漂浮,可不棄Lipofectamine-DNA液,加入6ml DMEM完全培養(yǎng)基,37℃孵育過夜,再換液。
7、培養(yǎng)過程中觀察細(xì)胞生長(zhǎng)情況。約2周后可觀察到細(xì)胞病變(CPE)出現(xiàn)(如用pAdTrack-CMV質(zhì)粒,由于含GFP,可觀察到綠色熒光)。
四、重組病毒鑒定
1、轉(zhuǎn)導(dǎo)10-14d后,收集細(xì)胞沉淀,加入2ml滅菌的PBS混懸,凍融細(xì)胞,離心后收集上清保存于-80℃。
2、取 30-50% 步驟 1 中上清,感染 50-70%飽和度的 25cm2 方瓶中 293 細(xì) 胞 。2-3d后出現(xiàn)明顯細(xì)胞病變。
3、感染后 3-5d,當(dāng) 1/3-1/2 細(xì)胞漂浮時(shí)收集病毒。按步驟 1 收集細(xì)胞并準(zhǔn)備病毒上清。通過 Western blot 和/或 PCR 鑒定重組腺病毒產(chǎn)生。
4、PCR 鑒定重組病毒。取 5?l 病毒上清加入 10?l 蛋白酶 K,55℃孵育 1hr,再煮沸 5min,離心后取 1-2?l 作 PCR。
五、重組病毒擴(kuò)增,純化
1、75cm2方瓶中接種 293 細(xì)胞,至密度達(dá)到 90%,加入適量病毒上清感染細(xì)胞。3-4d 后,細(xì)胞幾乎變圓,且有一半細(xì)胞漂浮,則收集所有細(xì)胞。約 500g 轉(zhuǎn)速離心,棄上清。
2、以滅菌 PBS 重懸沉淀,反復(fù)凍融 4 次。4℃下 7000g 離心 5min.病毒純化至少需要 30 瓶 75cm2方瓶細(xì)胞。
3、CsCl 連續(xù)梯度離心純化:50ml 離心管中稱量 4.4g CsCl,加入 8ml 病毒裂解上清液,混勻,體積約為 10ml。轉(zhuǎn)移至 12ml 超速離心管(用于 SW41 轉(zhuǎn)頭)中,覆蓋約 2ml 礦物油。平衡后,10℃下 32000 rpm 離心 18-24hr,用注射器抽吸離心出的病毒帶。(也可 CsCl 不連續(xù)梯度離心:20ml 超速離心管中緩慢加入 8ml CsCl 1.4 (53 g +87 mL 10 mM Tris-HCl,pH=7.9),上面小心加入 6 mL CsCl 1.2 (26.8 g + 92 mL10 mM Tris-HCl,pH=7.9),再小心加入病毒上清液至體積達(dá)到 20ml。平衡 后 ,4℃下 23000rpm 離心 90min (SW28 轉(zhuǎn)頭),用注射器抽吸下層藍(lán)白色病毒帶)
4、病毒透析去鹽:配置透析液(10 mM Tris pH 8.0, 2 mM MgCl2, 5% sucrose),滅菌處理。4℃透析,更換3次透析液,可基本去除CsCl,病毒保存于-80℃。
六病毒滴度測(cè)定(TCID50)
1、細(xì)胞準(zhǔn)備:96孔板中接種100?l 293細(xì)胞,每孔細(xì)胞數(shù)約104個(gè),以2% DMEM培養(yǎng)
2、稀釋病毒液準(zhǔn)備:以2% DMEM將病毒液稀釋成8個(gè)較高濃度(如10-3-10-10),每個(gè)濃度重復(fù)10個(gè),每孔加入病毒稀釋液100?l。另留兩排不加病毒液作為陰性對(duì)照。37℃下,孵箱培養(yǎng)10天。
3、10d后觀察細(xì)胞,記數(shù)每排出現(xiàn)CPE的孔數(shù),計(jì)算細(xì)胞病變率。(如某一濃度各孔細(xì)胞全部病變,比率為1,如無細(xì)胞病變,則比率為0)。
4、計(jì)算T =10×101 + d (S - 0.5) /mld = Log 10 稀釋度(如為10倍稀釋℃,d=1)S = 各濃℃細(xì)胞病變比率之和實(shí)驗(yàn)室重組腺病毒常用質(zhì)粒:病毒骨架質(zhì)粒:pAdEasy-1, pAdEasy-2穿梭質(zhì)粒:p-Shuttle, p-Shuttle-CMV, pAdTrack, pAdTrack-CMV。

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