2.將 4 張 82mm 的 nitrocellulose membranes(NC)浸入稀釋后的 E.coli/ phage
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血清學(xué)篩選克隆新抗原/新基因

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時間:2021-05-20     
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一、E.coli/phage裂解液預(yù)吸附血清


1.將 E.coli /phage lysate 以 1:10-20 稀釋在 TBST 溶液中。


2.將 4 張 82mm 的 nitrocellulose membranes(NC)浸入稀釋后的 E.coli/ phagelysate 中,室溫下水平搖動 30 分鐘,取出 NC 并使膜瀝干。


3.用 50ml TBST 溶液洗膜 3 次,每次 10 分鐘。


4.用濾紙輕輕吸去膜上的液體。


5.將膜放入 50ml 封閉液中,室溫下水平搖動最少 30 分鐘。


6.將膜從封閉液中取出,用 50ml TBST 溶液洗膜 3 次,每次 10 分鐘。


7.將血清按 1:5 稀釋在 TBST 溶液中,將一張膜放入溶液中,37℃下輕輕水平搖動 10 分鐘。


8.從血清稀釋液中取出膜并丟棄,加入另外一張新膜,37℃下輕水平搖 10 分鐘.


9.重復(fù)步驟 8,直至所有 4 張膜都處理完。


10. 除去最后一張膜,收集血清(primary antibody),分裝成小份儲存于-80℃冰箱中待用。


注意:


該步處理過程是為了去除血清中能與細(xì)菌和噬菌體裂解蛋白進(jìn)行免疫反應(yīng)的抗體,這樣可以減少假陽性率;


一抗不能反復(fù)凍融,化凍后不要再次冰凍,可放于 4℃作短暫保存。可以是病人血清,也可以是免疫血清,如果是病人血清,則需要至少 10個病人血清進(jìn)行混合;


二、噬菌體篩選


1.準(zhǔn)備 NZY agar plates(至少用前 24 小時倒好),用前在 37℃培養(yǎng)箱中烘烤1-2 小時以去除水滴。


2.將過夜培養(yǎng)的 XL1-blue MRF’細(xì)菌 2000 轉(zhuǎn)/分,離心 10 分鐘,將細(xì)菌溶解在10mM MgSO4 中,調(diào)整細(xì)菌濃度為 OD600=0.5。


3.融化 NZY top,并將 NZY top 放在 50℃水浴中。


4.將適量的 XL1-blue MRF’細(xì)菌溶液與一定稀釋度的 phage 文庫混合,37℃下共同作用 15 分鐘。直徑 90mm 平板:200?l XL1-blue 細(xì)菌+適量的 phage 文庫直徑 150mm 平板:600?l XL1-blue 細(xì)菌+適量的 phag 文庫(噬菌斑數(shù)量一般保持在 3000pfu/90mm; 12000pfu/150mm)


5.將步驟 4 中的混合液與 NZY top 溶液混合(200?l 混合液+3-4mlNZY top 溶液;600?l 混合液+8-10 ml NZY top 溶液),倒入到 NZY agar plates 中,室溫下放 10 分鐘左右,然后倒置放于 37℃下培養(yǎng)。


6.當(dāng)噬菌斑剛好可看到時(大約 5-8 小 時 ),從培養(yǎng)箱中拿出平板。


7.將 NC 放入 10mM IPTG 溶液中完全浸濕,在空中使膜瀝干,并做好 3 個不對稱的標(biāo)記。


8.將 IPTG 處理好的 NC 貼在平板上,不留氣泡,然后倒置放于 37℃下培 養(yǎng) 。


9.過夜培養(yǎng)后,第二天早上取出平板,用鑷子將膜輕輕掀起,注意不要將培養(yǎng)基粘在膜上。


10. 將膜放于 50ml TBST 溶液中,水平脫色搖床上震蕩洗膜 3 次,每次 10 分鐘。


11. 將膜放入 50ml 封閉液中,水平搖動,封閉 4-6 小時。


12. 在封閉液中加入適當(dāng)?shù)味鹊囊豢梗綋u動處理過夜。


13. 將膜放于 50ml TBST 溶液中,洗膜 3 次,每次 10 分鐘。


14. 在封閉液中加入適當(dāng)?shù)味鹊亩梗ǜ鱾€公司的二抗使用滴度不同),室溫水平搖動 1-2 小時。


15. 將膜放于 50ml TBST 溶液中,洗膜 3 次,每次 10 分鐘,最后用 50ml TBS溶液洗膜 15-20 分鐘,取出膜空氣中瀝干。


16. 將膜放入 BCIP-NBT 顯色液中避光顯色,水平搖動直到陽性斑點可見為止。


17. 從顯色液中取出膜放在 TBS 溶液中,空氣中使膜干燥。


18. 根據(jù)所做的標(biāo)記,將膜與平板對齊,將平板上對應(yīng)的陽性克隆區(qū)域的培養(yǎng)基挖出放入 500?l SM buffer 中,并加入 25 ml chloroform,4℃貯存(最多可貯 6 月)。


19. 第一輪篩選得到陽性克隆需要進(jìn)行第二輪篩選以去除假陽性并獲得陽性單克隆噬菌體。過程如第一輪篩選,只不過用直徑 90mm 平板;具體過程見步驟 4,這時所加入的噬菌體溶液是第一輪篩選得到的噬菌體上清(見步驟 18),在用前要滴定好噬菌體的滴度,噬菌斑的數(shù)量以可區(qū)分出單個克隆,同時密度不能太稀為標(biāo)準(zhǔn)(一般 100-200 pfu/90mm)。20. 按第一輪相似的過程進(jìn)行實驗,最后顯色,確定真正的陽性克隆,并將陽性單克隆所在的培養(yǎng)基挖出放入 500?l SM buffer 中,并加入 25 ml chloroform,4℃貯存(最多可貯存 6 月 )。


注意:

封閉液一般可用:5%的脫脂牛奶或 1%的 BSA 溶解在 TBST 溶液中。第一輪篩選用 150mm 的平板;第二輪篩選用 90mm 的平板,一般需要篩選至少 1 x 106 pfu。認(rèn)真做好三個不對稱的標(biāo)記,特別在第二輪挑選陽性克隆時要仔細(xì)將膜與平板吻合好,不能挑錯。


三、單克隆剪切


1.取第二輪篩選得到的陽性克隆貯存液上清。


2.將過夜培養(yǎng)的 XL1-blue MRF’細(xì)菌 2000 轉(zhuǎn)/分離心 10 分鐘,將細(xì)菌溶解在10mM MgSO4 中,調(diào)整細(xì)菌溶度到 OD600=1.0。


3.在一個 EP 管中加入:200?l XL1-blue MRF’細(xì)菌+250ul phage stock(步驟 1)+1 ul ExAssist helper phage。


4.將以上三種樣品混合,37℃下共同保溫 15 分鐘。


5.將樣品混合物加入到 3 ml LB 培養(yǎng)基中,37℃震蕩培養(yǎng) 3-4 小時。


6.將試管放于 65-70℃水浴 20 分鐘,3000 轉(zhuǎn)/分,離心 15 分鐘。


7.將上清轉(zhuǎn)入新的離心管中,已發(fā)生剪切的 phage particles 在上清中(上清可在 4℃下儲存 1-2 月 )。


8.將 100ul phage 上清+200ul SOLR cells(OD600=1.0)混合,37℃保溫 15 分鐘 。


9.取步驟 8 中溶液 5-10 ul 涂于 LB-amp agar plates(amp=50ug/ml),過夜培養(yǎng) 。


10. 第二天細(xì)菌長出,隨機挑取單克隆接種到 LB-amp 培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜。


11. 過夜培養(yǎng)細(xì)菌分為三部分:(1)提取質(zhì)粒做雙酶切,鑒定外源基因的大小;(2)送樣品進(jìn)行 DNA 測序(3)加入 30-40%的甘油進(jìn)行保種,分裝成小份儲存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>


附錄:


1SMbuffer(1L):

(5.8 g NaCl+2.0 g magnesium sulfate+50 ml 1M Tris (pH=7,5)+0.1 g gelatin)


2、AP-buffer:

(100 mM Tris HCI (pH 9.5) ;

100 mM NaCl ;

5 mM MgCl2)


3、10xTBS(1L):

(0.1 M Tris-HCl (pH 8.0);1.5 M NaCl)


4、LBBroth(1L):

(10 g NaCl+10 g of tryptone+5 g of yeast extract)

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