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EpigenTek:RNA甲基化研究

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時(shí)間:2025-02-05     
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我們提供最全面的RNA甲基化研究產(chǎn)品,涵蓋實(shí)驗(yàn)流程的每一步,從上游到下游。借助EpigenTek的RNA甲基化產(chǎn)品系列,拓展您對(duì)RNA的理解 

m6a-RNA-1.png

什么是RNA甲基化?

RNA甲基化是一種RNA的轉(zhuǎn)錄后修飾,它通過(guò)改變基因調(diào)控而不改變結(jié)構(gòu)基因序列來(lái)發(fā)揮作用。這種修飾在包括病毒在內(nèi)的眾多生物物種中都有發(fā)現(xiàn),并與重要的生物學(xué)過(guò)程密切相關(guān)。與DNA甲基化類(lèi)似,RNA甲基化是可逆的,在生命中廣泛存在,主要涉及甲基基團(tuán)的添加。然而,RNA甲基化在不同類(lèi)型的RNA中的分布并不均勻。RNA甲基化發(fā)生在tRNA、rRNA、mRNA、tmRNA、snRNA、snoRNA、miRNA和病毒RNA中。mRNA上較為熟悉的兩種修飾包括N6-甲基腺苷(m6A)和5-甲基胞嘧啶(5mC)。 

在所有化學(xué)上不同的RNA修飾中,N6-甲基腺苷(m6A)是最常見(jiàn)的。它涉及腺苷堿基在氮-6位的甲基化。通常被稱(chēng)為“第五RNA堿基”,m6A占真核生物中所有RNA甲基化的80%以上。特別是,這種RNA修飾被認(rèn)為對(duì)mRNA調(diào)控很重要,因?yàn)閙6A在3'非翻譯區(qū)(3'UTR)富集。此外,它還與多種癌癥相關(guān),包括白血病、乳腺癌和前列腺癌。  

另一種在各種RNA分子中發(fā)現(xiàn)的豐富的表觀遺傳標(biāo)記是5-甲基胞嘧啶(5mC),它涉及在5-碳環(huán)上添加甲基基團(tuán)。據(jù)報(bào)道,5mC存在于多種不同的RNA類(lèi)型中,包括rRNA、tRNA、eRNA以及mRNA和各種非編碼RNA。檢測(cè)RNA中5mC修飾的最理想方法是通過(guò)亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后進(jìn)行高通量測(cè)序。  


哪種RNA甲基化工具適合您的實(shí)驗(yàn)?

RNA修飾,尤其是RNA甲基化的重要性是顯而易見(jiàn)的。然而,RNA甲基化研究領(lǐng)域仍處于起步階段。許多已建立的檢測(cè)方法嚴(yán)重依賴于抗體依賴的轉(zhuǎn)錄組范圍技術(shù),其中大多數(shù)集中在RNA中m6A的發(fā)生上,因?yàn)槠渖飳W(xué)作用已被廣泛研究。5mC RNA檢測(cè)技術(shù),包括亞硫酸氫鹽測(cè)序,也引起了關(guān)注,因?yàn)?mC RNA與多種細(xì)胞過(guò)程和腫瘤發(fā)生有關(guān)。新的生化方法與高通量測(cè)序相結(jié)合,使得研究整個(gè)轉(zhuǎn)錄組以及繪制單個(gè)修飾成為可能,揭示RNA修飾酶或蛋白質(zhì)結(jié)合因子的真正功能。 

在開(kāi)始您的RNA甲基化研究項(xiàng)目之前,我們建議回顧與您計(jì)劃實(shí)驗(yàn)相關(guān)的任何可用文獻(xiàn)。如果其他研究人員進(jìn)行了類(lèi)似的工作,您應(yīng)該利用他們的信息,并將其作為您研究的基礎(chǔ),仔細(xì)審查以避免潛在的障礙。 

如果您希望分析RNA中m6A或5mC修飾的全局水平,我們建議從對(duì)樣本中甲基化狀態(tài)的簡(jiǎn)單預(yù)篩查開(kāi)始。這些方法可通過(guò)我們的熱門(mén)產(chǎn)品——m6A RNA甲基化定量試劑盒和5-mC RNA甲基化ELISA試劑盒實(shí)現(xiàn)。對(duì)于直接靶向m6A或5mC,我們建議使用我們的m6A富集試劑盒或亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒。 

訪問(wèn)我們的RNA甲基化資源中心,獲取更多關(guān)于RNA甲基化的有用信息。為了方便您了解我們的產(chǎn)品,我們還詳細(xì)介紹了RNA甲基化產(chǎn)品的優(yōu)勢(shì)。對(duì)于涉及病毒和宿主RNA修飾的研究,請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的表觀遺傳病毒RNA修飾工作流程頁(yè)面。  

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RNA甲基化研究步驟詳細(xì)信息

 

1. RNA分離提取

RNA分離是任何RNA甲基化研究的關(guān)鍵第一步。我們的RNA制備試劑盒能夠在短時(shí)間內(nèi)高效分離來(lái)自組織、培養(yǎng)細(xì)胞和無(wú)細(xì)胞液體樣本(特別是唾液和鼻咽拭子)的總RNA。純化的RNA可用于多種常規(guī)應(yīng)用,如RT-PCR、cDNA合成、Northern blot、差異顯示、引物延伸和mRNA選擇。

編號(hào)名稱(chēng)描述
P-9105EpiQuik總RNA分離快速試劑盒使用柱式方法在約30分鐘內(nèi)從細(xì)胞或組織中分離總RNA
P-9106EpiQuik磁珠快速RNA分離試劑盒使用磁珠方法在約30分鐘內(nèi)從細(xì)胞或組織中分離總RNA

查看更多提取試劑盒:點(diǎn)擊鏈接 


2. 整體m6A和5mC RNA定量

EpigenTek的m6A和5mC RNA甲基化試劑盒使研究人員能夠輕松確定RNA甲基化如何影響他們的研究項(xiàng)目。我們的試劑盒可以直接定量N6-甲基腺苷(m6A)或測(cè)量任何物種(包括哺乳動(dòng)物、植物、真菌、細(xì)菌和病毒)分離的總RNA中的5-mC。

編號(hào)名稱(chēng)描述文章數(shù)量
P-9005EpiQuik m6A RNA甲基化定量試劑盒(比色法)在不到4小時(shí)內(nèi)比色法定量RNA中的N6-甲基腺苷(m6A/6mA)680+
P-9008EpiQuik m6A RNA甲基化定量試劑盒(熒光法)在不到4小時(shí)內(nèi)熒光法定量RNA中的N6-甲基腺苷(m6A/6mA)12
P-9015MethylFlash尿液m6A定量試劑盒通過(guò)類(lèi)似ELISA的方法在4小時(shí)內(nèi)定量尿液中的N6-甲基腺苷新產(chǎn)品
P-9009MethylFlash 5-mC RNA甲基化ELISA簡(jiǎn)易試劑盒在2小時(shí)40分鐘內(nèi)定量RNA中的5-mC12

 

3. RNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和cDNA合成

亞硫酸氫鹽處理技術(shù),也稱(chēng)為亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化,是準(zhǔn)備RNA進(jìn)行特異性甲基化分析的理想方法。該過(guò)程將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,可通過(guò)高通量測(cè)序輕松區(qū)分。亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后的RNA還可用于生成cDNA,用于分析甲基化狀態(tài)的各種下游應(yīng)用。

編號(hào)名稱(chēng)描述
P-9003Methylamp RNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒用于基于化學(xué)的RNA亞硫酸氫鹽處理,以分析甲基化胞嘧啶
P-9004EpiNext高保真cDNA合成試劑盒專(zhuān)門(mén)使用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的RNA和富集的RNA片段合成DNA副本
P-9007EpiNext 5-mC RNA亞硫酸氫鹽測(cè)序簡(jiǎn)易試劑盒用于簡(jiǎn)化RNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和NGS文庫(kù)準(zhǔn)備,用于5-甲基胞嘧啶RNA測(cè)序

 

4. NGS文庫(kù)準(zhǔn)備

文庫(kù)準(zhǔn)備是下一代測(cè)序(NGS)的關(guān)鍵步驟。我們?yōu)镹GS提供了許多經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的解決方案,包括方便地從難以處理的樣本中構(gòu)建高質(zhì)量的RNA/DNA文庫(kù),可用于各種基于Illumina的平臺(tái)。

編號(hào)名稱(chēng)描述
P-1053EpiNext高靈敏度DNA文庫(kù)準(zhǔn)備試劑盒從極少量樣本中準(zhǔn)備DNA文庫(kù),用于下一代測(cè)序應(yīng)用
P-1060EpiNext NGS條形碼(Index)套裝-12用于構(gòu)建用于Illumina平臺(tái)(包括GAIIx、HiSeq、MiSeq和NextSeq)的多重RNA/DNA文庫(kù)

 

5. MeRIP和m6A-Seq分析

使用我們的CUT&RUN RNA m6A富集試劑盒獲得m6A RNA的高分辨率圖譜。憑借獨(dú)特的核酸酶混合物,這些試劑盒僅分離抗體結(jié)合位置的RNA片段,并同時(shí)切割/去除目標(biāo)區(qū)域下方的RNA序列片段。我們的試劑盒可以從低輸入量的RNA中富集含有m6A修飾的RNA片段,非特異性背景水平極低。CUT&RUN RNA m6A-Seq試劑盒還包括文庫(kù)準(zhǔn)備步驟,作為額外優(yōu)勢(shì)。

編號(hào)名稱(chēng)描述
P-9018EpiQuik CUT&RUN m6A RNA富集試劑盒基于CUT&RUN的MeRIP,提高特異性和信號(hào)
P-9016EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq試劑盒基于CUT&RUN的MeRIP和NGS文庫(kù)準(zhǔn)備一體化試劑盒

 

6. 研究RNA甲基化的抗體

N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物中RNA分子中最常見(jiàn)和最豐富的修飾之一。m6A的化學(xué)性質(zhì)使其難以區(qū)分,因此分析這種修飾的方法高度依賴于抗m6A抗體的質(zhì)量。我們的多克隆和單克隆m6A抗體可用于特異性檢測(cè)RNA中的m6A。它們經(jīng)過(guò)嚴(yán)格測(cè)試,保證在各自的應(yīng)用中有效。

編號(hào)名稱(chēng)描述
A-1801N6-甲基腺苷(m6A)多克隆抗體高特異性針對(duì)N6-甲基腺苷(m6A)的多克隆抗體
A-1802N6-甲基腺苷(m6A)單克隆抗體 [2H6]高特異性針對(duì)N6-甲基腺苷(m6A)的單克隆抗體

  

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