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冠狀病毒(CoVs)可引起人類和動(dòng)物的呼吸道及腸道感染。在新冠病毒(SARS-CoV-2)的復(fù)制周期中,3CL蛋白酶(又稱主蛋白酶Mpro)起著至關(guān)重要的作用——它負(fù)責(zé)切割病毒RNA翻譯產(chǎn)生的多聚蛋白前體,將其加工為成熟的非結(jié)構(gòu)蛋白,進(jìn)而組裝成具有功能的病毒復(fù)制-轉(zhuǎn)錄復(fù)合體。由于3CL蛋白酶在病毒復(fù)制中的核心地位,其氨基酸序列在不同冠狀病毒中高度保守,且在人體內(nèi)不存在同源蛋白酶,因此成為抗病毒藥物研發(fā)的理想靶點(diǎn)。能夠阻斷病毒復(fù)制的蛋白酶抑制劑,是極具潛力的COVID-19治療候選藥物。
為滿足科研人員在3CL蛋白酶抑制劑篩選、酶動(dòng)力學(xué)研究及藥物發(fā)現(xiàn)中的需求,艾美捷代理BPS Bioscience公司推出的無標(biāo)簽3CL蛋白酶檢測試劑盒提供了一套完整、靈敏、高通量兼容的解決方案。該試劑盒采用均相熒光法(homogeneous assay),無需繁瑣的洗滌步驟,以96孔板或384孔板格式提供,包含純化的無標(biāo)簽3CL重組蛋白酶、熒光底物及優(yōu)化緩沖液,并內(nèi)置陽性對照抑制劑GC376。

圖1:3CL蛋白酶測定原理示意圖。
3CL蛋白酶底物是一種內(nèi)部猝滅的14聚體熒光肽(DABCYL-KTSAVLQSGFRKME-EDANS)。當(dāng)供體(EDANS)和受體(DABCYL)熒光團(tuán)緊密靠近時(shí),EDANS發(fā)出的能量會(huì)被DABCYL(完整的底物)猝滅。在3CL的蛋白酶解作用下,肽底物在谷氨酰胺和絲氨酸殘基之間被切割,生成高熒光肽片段(SGFRKME-EDANS)。熒光強(qiáng)度與3CL的活性成正比。
一、檢測原理:基于FRET的熒光法
本試劑盒的核心檢測技術(shù)是熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET) 。試劑盒提供的3CL蛋白酶底物是一個(gè)14個(gè)氨基酸殘基組成的熒光多肽(序列為DABCYL-KTSAVLQSGFRKME-EDANS)。該多肽的兩端分別標(biāo)記了兩種熒光基團(tuán):EDANS(供體) 和DABCYL(受體) 。在完整底物中,EDANS與DABCYL在空間上相互靠近,EDANS受激發(fā)后產(chǎn)生的熒光能量被DABCYL吸收并淬滅,因此底物本身不發(fā)出熒光。
當(dāng)加入3CL蛋白酶后,該酶特異性切割底物中谷氨酰胺(Q)與絲氨酸(S)之間的肽鍵,產(chǎn)生含有EDANS標(biāo)記的熒光肽片段SGFRKME-EDANS。切割后,EDANS與DABCYL分離,淬滅作用消失,EDANS受激發(fā)后發(fā)出強(qiáng)烈的熒光信號(hào)。EDANS的激發(fā)峰位于336 nm,發(fā)射峰位于455 nm,熒光強(qiáng)度與3CL蛋白酶的活性成正比。
這種“切割即發(fā)光”的設(shè)計(jì)原理,使檢測過程無需分離未切割底物,真正實(shí)現(xiàn)了“均相免洗”(add-mix-read) ,極大地簡化了操作流程,尤其適合自動(dòng)化高通量篩選。
二、試劑盒核心組分與設(shè)計(jì)優(yōu)勢
1. 即用型完整組分,操作高效
試劑盒提供所有必需成分:
純化的無標(biāo)簽重組3CL蛋白酶(BPS Bioscience 100823),保留了天然酶的全部活性,避免了標(biāo)簽可能帶來的空間位阻干擾。
FRET熒光底物(BPS Bioscience 79952),序列經(jīng)過優(yōu)化,具有高靈敏度和高特異性。
3CL蛋白酶檢測緩沖液,優(yōu)化了pH和鹽離子組成,確保酶反應(yīng)在最適條件下進(jìn)行。
陽性對照抑制劑GC376,用于驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)體系的可靠性。
黑色低吸附微孔板及板封膜(部分規(guī)格)。
2. 陽性對照GC376:內(nèi)置的質(zhì)量控制
試劑盒中包含的GC376是一種已知的冠狀病毒3CL蛋白酶抑制劑,其作用機(jī)制是與3CL蛋白酶活性中心的半胱氨酸殘基形成共價(jià)鍵,從而不可逆地抑制酶活性。文獻(xiàn)報(bào)道中,GC376對SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的IC50可達(dá)0.060 μM,被廣泛用作抑制劑篩選實(shí)驗(yàn)的陽性對照。在每次實(shí)驗(yàn)中,使用GC376作為對照,可以驗(yàn)證酶活性、底物切割效率及檢測體系的有效性,確保篩選數(shù)據(jù)的可信度。
3. 均相免洗設(shè)計(jì),適合高通量篩選
傳統(tǒng)的ELISA方法需要多步洗滌,操作繁瑣且耗時(shí)長。本試劑盒采用均相(homogeneous)檢測模式,所有反應(yīng)在同一孔中進(jìn)行,無需洗滌步驟,僅需“加樣-混合-孵育-讀數(shù)”四個(gè)步驟即可完成檢測。這種設(shè)計(jì)不僅節(jié)省了時(shí)間,還減少了操作誤差,尤其適合高通量篩選(HTS) 應(yīng)用——配合自動(dòng)化移液工作站,可在單次實(shí)驗(yàn)中完成數(shù)千個(gè)化合物的初篩。
4. 96孔與384孔雙規(guī)格,靈活適配不同通量
該試劑盒提供96孔板格式(支持100次酶反應(yīng))和384孔板格式(支持400次酶反應(yīng))兩種規(guī)格,用戶可根據(jù)實(shí)驗(yàn)規(guī)模靈活選擇。384孔格式的單位反應(yīng)成本更低,更適合大規(guī)模化合物庫篩選。
三、應(yīng)用場景與科研價(jià)值
1. 3CL蛋白酶抑制劑的高通量篩選
這是試劑盒的核心應(yīng)用場景。研究人員可以將待測化合物(小分子藥物、天然產(chǎn)物、多肽等)與3CL蛋白酶預(yù)孵育后,加入FRET底物啟動(dòng)反應(yīng)。通過檢測熒光信號(hào)的變化,定量評估化合物對3CL蛋白酶活性的抑制效果。結(jié)合劑量-反應(yīng)曲線擬合,可快速測定各化合物的IC50值,為后續(xù)構(gòu)效關(guān)系研究提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。
2. 酶動(dòng)力學(xué)研究
利用試劑盒中的純化重組酶和底物,研究人員可以測定3CL蛋白酶的關(guān)鍵酶動(dòng)力學(xué)參數(shù),包括米氏常數(shù)(Km)、最大反應(yīng)速率(Vmax)和催化效率(kcat/Km)。這些參數(shù)有助于深入理解3CL蛋白酶的催化機(jī)制,并為抑制劑設(shè)計(jì)提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
3. 耐藥突變體的活性評估
隨著抗病毒藥物的廣泛使用,新冠病毒已出現(xiàn)多種耐藥突變株(如Nirmatrelvir耐藥突變)。該試劑盒的核心組分——無標(biāo)簽3CL蛋白酶——可替換為特定突變體的重組酶,用于評估不同突變對酶活性的影響及對現(xiàn)有抑制劑的敏感性變化,為下一代抑制劑開發(fā)提供依據(jù)。
4. 聯(lián)合用藥策略研究
多項(xiàng)研究表明,3CL蛋白酶抑制劑與其他抗病毒藥物(如RNA聚合酶抑制劑瑞德西韋)聯(lián)合使用可能產(chǎn)生協(xié)同抗病毒效果。利用該試劑盒,可在分子層面評估藥物聯(lián)用對3CL蛋白酶活性的抑制效果,為聯(lián)合用藥方案的設(shè)計(jì)提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
四、技術(shù)參數(shù)與操作要點(diǎn)
規(guī)格與儲(chǔ)存
檢測格式:熒光法(均相,無需洗滌)
激發(fā)/發(fā)射波長:336 nm / 455 nm(EDANS)
物種:SARS-CoV-2
運(yùn)輸溫度:-80°C(干冰)
穩(wěn)定性:按照指示儲(chǔ)存,試劑盒在收貨后6個(gè)月內(nèi)保持最佳性能
監(jiān)管狀態(tài):僅限研究使用(Research Use Only),不可用于臨床診斷
材料要求(試劑盒不提供)
具備激發(fā)/發(fā)射波長360 nm/460 nm檢測能力的熒光微孔板讀數(shù)儀
注意事項(xiàng)
DMSO兼容性:待測化合物通常溶解于DMSO,反應(yīng)體系中DMSO終濃度不應(yīng)超過1%。
避免反復(fù)凍融:3CL蛋白酶對溫度敏感,建議收到后分裝保存于-80°C,避免多次凍融導(dǎo)致活性下降。
熒光干擾排除:若待測化合物本身具有熒光,需評估其在檢測波長下的自發(fā)熒光強(qiáng)度。建議設(shè)置化合物單獨(dú)對照孔,以排除假陽性/假陰性結(jié)果。
陽性對照:每次實(shí)驗(yàn)均應(yīng)設(shè)置GC376陽性對照組,以監(jiān)控實(shí)驗(yàn)體系的可靠性。
五、文獻(xiàn)參考
1. Jared S. Morse, et al., 2020 Chem.Bio.Chem. 21:730–738.
2. Zhang, L., et al. 2020, Science 368 (6489): 409-412.
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