EpiNext染色質(zhì)可及性測序快速試劑盒是一套完整的優(yōu)化試劑，專為通過下一代測序技術(shù)對各種生物樣本的染色質(zhì)可及性進(jìn)行全基因組分析而設(shè)計，包括核小體/轉(zhuǎn)錄因子定位。

艾美捷Epigentek-EpiNext染色質(zhì)可及性測序快速試劑盒（#P-1071-12）具有以下優(yōu)勢：

極快速的三步協(xié)議：僅需1小時55分鐘即可完成從細(xì)胞/組織樣本到測序就緒文庫DNA的整個流程，比ATAC-seq更快。該方法可最大限度減少核損傷，保留染色質(zhì)結(jié)構(gòu)，并避免線粒體污染。

用途廣泛：適用于新鮮/冷凍組織的小細(xì)胞量樣本，即使在惡劣環(huán)境下也能使用，與DNAse-seq/MNase-seq相比具有明顯優(yōu)勢。

減少偏差：由于缺乏序列特異性切割，該方法可最大限度減少片段化偏差以及與GC或AT含量相關(guān)的偏差。

全面的試劑盒：包含每個步驟所需的所有必要組分，確保EpiNext染色質(zhì)可及性測序快速試劑盒的便捷性和成本效益。

原理與流程：

該試劑盒包含從細(xì)胞/組織樣本通過NGS進(jìn)行染色質(zhì)可及性全基因組分析所需的所有必要試劑。在此實驗中，從細(xì)胞/組織中分離出細(xì)胞核，并將其暴露于獨(dú)特的核酸切割酶混合物中。染色質(zhì)被片段化，目標(biāo)染色質(zhì)兩端的DNA序列被切割/移除，而目標(biāo)蛋白/組蛋白占據(jù)的DNA序列則不受影響。然后將接頭連接到目標(biāo)蛋白/組蛋白結(jié)合的DNA片段上。連接后的DNA被釋放、純化，并使用高保真PCR混合液進(jìn)行文庫DNA構(gòu)建。

左圖. EpiNext染色質(zhì)可及性測序快速試劑盒的流程示意圖。

右圖. EpiNext染色質(zhì)可及性測序DNA文庫的特性分析。

從100,000個MCF-7細(xì)胞中分離的染色質(zhì)被切割并用于EpiNext染色質(zhì)可及性測序快速試劑盒的DNA文庫制備。該文庫通過Bioanalyzer進(jìn)行分析。

起始材料與輸入量：

起始材料可以包括各種哺乳動物組織或細(xì)胞樣本，例如來自燒瓶或微孔板培養(yǎng)的細(xì)胞、新鮮和冷凍組織等。最佳反應(yīng)所需的細(xì)胞/組織量可以從50,000個細(xì)胞或5 mg組織到500,000個細(xì)胞或50 mg組織不等。