定制的PNA寡聚物可以未標(biāo)記或通過(guò)染料或其他化學(xué)物質(zhì)標(biāo)記。它們也可以與肽綴合以添加其他功能。可以添加連接體作為間隔物并且還可以提高溶解度。γ-PNA或修飾的堿基可以進(jìn)一步增加PNA的Tm和特異性。

艾美捷PNA Bio-定制PNA寡聚物：

PNA/DNA雙鏈通常比相應(yīng)的DNA/DNA雙鏈具有更高的熔解溫度（Tm）。大致上，每增加一個(gè)堿基對(duì)，熔解溫度提高約1°C。

由于對(duì)互補(bǔ)DNA序列具有高結(jié)合親和力，通常不需要設(shè)計(jì)長(zhǎng)的PNA寡核苷酸進(jìn)行雜交。12-21個(gè)堿基的PNA寡核苷酸Z為常見(jiàn)。

強(qiáng)烈建議避免任何自互補(bǔ)序列，如反向重復(fù)、形成發(fā)夾和回文序列，因?yàn)镻NA/PNA之間的相互作用比PNA/DNA之間的相互作用更強(qiáng)。

還建議避免富含嘌呤的序列，因?yàn)樗鼈冇捎谠谒芤褐腥芙舛鹊投鴥A向于聚集。盡量將嘌呤含量限制在60%以下。同時(shí)盡量避免超過(guò)6個(gè)嘌呤的連續(xù)序列，特別是連續(xù)4個(gè)或更多的G堿基。

為了提高PNA探針的溶解性，可以添加溶解性增強(qiáng)劑，如O型連接物、E型連接物、X型連接物或兩個(gè)賴(lài)氨酸。

PNA Bio-gamma PNA：

伽馬PNA在N-氨基乙基甘氨酸單元的γ-碳原子上有一個(gè)立體異構(gòu)中心。γ-取代PNA可以放置在常規(guī)PNA的每一個(gè)第三殘基中。

伽馬PNA的熔解溫度（Tm）每單個(gè)取代比普通PNA高出5~8℃，這導(dǎo)致具有更高的親和力和更序列特異性的結(jié)合。此外，伽馬PNA可以侵入雙鏈DNA形成三螺旋結(jié)構(gòu)。

此外，伽馬PNA還可以提供幾個(gè)優(yōu)勢(shì)，如改善的溶解性、更少的自聚集、更穩(wěn)定的PNA-DNA雙鏈形成，以及為多重標(biāo)記和其他功能化提供的靈活性。

可能的伽馬功能團(tuán)：

1、賴(lài)氨酸：更好的溶解性，可能用于雙重標(biāo)記，具有細(xì)胞穿透的潛力

2、丙氨酸和谷氨酸也是可能的修飾選項(xiàng)。

由于其高親和力和特異性，PNA寡核苷酸可以高效地與其靶標(biāo)核酸結(jié)合。未標(biāo)記PNA的一種流行用途是作為PCR反應(yīng)中特定基因的阻斷劑（PNA夾子）。這項(xiàng)技術(shù)可以高效地檢測(cè)目標(biāo)基因中的SNP突變。

PNA可以以任一方向與其靶標(biāo)核酸結(jié)合，但更傾向于反平行而非平行。默認(rèn)情況下，PNA從5'到3'或從N-到-C書(shū)寫(xiě)，就像DNA或肽一樣。它也從NH2-到-CONH2或從H到-NH2書(shū)寫(xiě)。PNA的5'端NH2-可以與其他功能團(tuán)共軛，而PNA的3'端-CONH2是一個(gè)非活性端。在5'端的乙酰化可以阻止任何潛在的反應(yīng)性。

由于PNA的熔解溫度（Tm）高于DNA，通常在大多數(shù)應(yīng)用中使用10~21個(gè)堿基的PNA。PNA的長(zhǎng)度越長(zhǎng)可能會(huì)降低溶解性。高嘌呤含量（>60%），特別是G堿基，可能是溶解度低的原因。根據(jù)序列，PNA可能的Z長(zhǎng)長(zhǎng)度約為40個(gè)堿基。然而，強(qiáng)烈建議檢查其Tm并設(shè)計(jì)具有適當(dāng)長(zhǎng)度和序列的探針。

為了提高PNA探針的溶解性，建議為長(zhǎng)鏈（>22個(gè)堿基）或高嘌呤含量（>60%）的PNA添加溶解性增強(qiáng)劑，如O型連接物、E型連接物、X型連接物或2個(gè)賴(lài)氨酸。這些連接物也可以作為與其他功能團(tuán)（如肽或染料）共軛的間隔物。

可能的連接物：

1、O型連接物（也稱(chēng)為AEEA或eg1）：提高溶解性，Z常用的

2、作為間隔物：O、E、X、C3、C4、C6、C12連接物

3、巰基添加：C6SH、C11SH

艾美捷科技是PNA Bio的中國(guó)代理商，為科研工作者提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù)。