PROGEN的AAV衣殼蛋白抗體識別病毒衣殼蛋白VP1、VP2和VP3的線性表位。AAV衣殼蛋白的高度序列相似性使得跨血清型的蛋白質易于檢測。

圖1顯示了三種衣殼蛋白和相應的抗體結合位點。由于所有VP蛋白都由相同的閱讀框編碼，由于使用了交替的起始密碼子和交替的剪接，它們僅在N端區(qū)域不同。結合C末端部分的抗體，如B1，能夠結合所有衣殼蛋白，而像A1這樣的抗體只能結合VP1，A69只能與VP1和VP2結合。

衣殼蛋白抗體可用于蛋白質印跡分析，以檢測VP1、VP2和VP3的表達水平，以及使用色譜、免疫沉淀或免疫熒光進行蛋白質定位研究或蛋白質-蛋白質相互作用。

艾美捷PROGEN-衣殼蛋白抗體結合位點和反應性：

針對AAV2衣殼蛋白在小鼠體內(nèi)產(chǎn)生的衣殼蛋白抗體，適用于所有檢測變性VP蛋白線性表位的應用，如西方墨點分析（Western blot分析）。

Serotype Antibody Residues* Binding Site

AAV2 A1 123-KRVLEPLGL-131 Binding site is located at the N-terminus of the VP1 protein. Detection of VP1 only.

AAV2 A69 171-LNFGQTGDADSV-182 Binding site is located at the N-terminus of the VP2 protein. Detection of VP1 and VP2.

AAV2 B1 726-IGTRYLTR-733 Binding site is located at the C-terminus common to all three VP proteins. Detection of VP1, VP2 and VP3.

*氨基酸位置與VP1序列有關。

表位作圖實驗（Wobus等人，2000）確定aa123至aa131（N-末端；）是單克隆A1抗體的特異性結合區(qū)。

Wobus，C.E.等人。抗腺相關病毒2型（AAV-2）衣殼的單克隆抗體：參與AAV-2細胞相互作用和AAV-2感染中和的衣殼結構域的表位定位和鑒定。J.Virol。74, 9281–93 (2000).

交叉反應性：

Antibody AAV1 AAV2 AAV3 AAV4 AAV5 AAV6 AAV7 AAV8 AAV9 AAVrh10 AAV11 AAV12 AAVDJ

A1 x x x   x x x x x   x x x

A69   x         na       na na x

B1 x x x   x x x x x x     x

VP51 na x na na x na na na na na na na na

————————————————————————————

x-反應性

na-未分析

空場-無反應性

A1

與所有常見血清型AAV1-12的VP1蛋白發(fā)生反應。在免疫沉淀中，偶爾可以看到與非AAV衍生蛋白的反應。

B1

由于來自不同AAV的VP蛋白序列高度相似，B1抗體顯示出與大多數(shù)測試過的AAV血清型的高交叉反應性。

使用AFDyes：

使用AFDye?標記的抗體，您可以在不使用第二抗體的情況下檢測您感興趣的蛋白質。這為您節(jié)省了寶貴的時間，因為您還可以通過使用不同標記的抗體（如AFDye 647和AFDye 488）同時檢測同一樣本中的不同蛋白質。

PROGEN為B1抗體提供兩種不同的AFDye?偶聯(lián)物：AFDye 647和AFDye 488。

Progen提供各種抗體用于鑒別AAV感染的不同階段以及rAAV的組裝分析。艾美捷科技是PROGEN的經(jīng)銷商，為科研工作者提供優(yōu)質的產(chǎn)品與服務。