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特色產品一、產品概述
本試劑盒專為體外鑒定和表征小 G 蛋白(Cdc42、Rac1 和 RhoA)的鳥嘌呤核苷酸交換因子(Guanine nucleotide Exchange Factor, GEF)而設計,Rho GTPases GEF 篩選試劑盒由Cytoskeleton推出,艾美捷代理。試劑盒采用熒光檢測方法,基于純化蛋白進行反應,不適用于細胞裂解液。該工具可支持 GEF 活性生化表征、新型 GEF 蛋白的篩選以及 GEF 抑制劑的高通量篩選。
二、核心應用場景
鑒定 Cdc42、Rac1 或 RhoA 的 GEF 蛋白:使用純化蛋白進行體外測定,快速判斷目標蛋白是否對特定 Rho GTPase 具有交換活性。
GEF 活性的生化表征:定量分析 GEF 的催化效率、底物特異性及動力學參數。
高通量篩選 GEF 抑制劑:采用 384 孔板格式,適用于大規模化合物文庫篩選,尋找靶向特定 GEF-Rho 相互作用的小分子調節劑。
三、試劑盒內容(每盒支持 20–130 次測定,視 GTPase 種類而定)
組分 | 說明
Exchange buffer | 交換緩沖液,提供反應所需離子環境
Cdc42-His 蛋白 | 重組 His 標簽 Cdc42 蛋白
RhoA-His 蛋白 | 重組 His 標簽 RhoA 蛋白
Rac1-His 蛋白 | 重組 His 標簽 Rac1 蛋白
hDbs-His 蛋白 | 重組 His 標簽人 Dbs 蛋白(已知 GEF,用作陽性對照)
384 孔板 | 高通量篩選用微孔板
96 孔板 | 常規檢測用微孔板
四、所需設備與材料
溫控熒光讀數儀:激發波長 485 nm ± 20 nm,發射波長 535 nm ± 20 nm。
移液器、多道移液器或自動液體處理工作站(推薦用于高通量篩選)。
純化待測 GEF 蛋白(用戶自備)或化合物文庫(用于抑制劑篩選)。
五、檢測原理
本試劑盒基于熒光標記的鳥嘌呤核苷酸類似物在自由狀態與結合狀態下的光譜差異。當熒光核苷酸類似物與 Rho GTPase 結合時,熒光強度顯著增強。在待測 GEF 存在下,GTPase 加速交換結合的 GDP 為熒光核苷酸類似物,導致熒光信號隨時間升高。通過監測熒光強度的變化速率,即可定量評估 GEF 活性。
檢測參數:
激發波長:485 nm
發射波長:535 nm
檢測時長:約 2 小時
六、生物活性測定方法(標準流程)
以下為使用已知 GEF(如 hDbs)驗證試劑盒性能的典型步驟。用戶可根據自身待測 GEF 進行調整。
1. 試劑準備
將 Exchange buffer 平衡至室溫。
解凍各 GTPase 蛋白(Cdc42、Rac1、RhoA)和陽性對照 hDbs 蛋白,置于冰上。
準備熒光核苷酸類似物(試劑盒未提供,需另行購買或按實驗室常規配方配制)。
2. 反應體系配制(96 孔板格式)
每孔終體積通常為 50–100 μl,包含:
1× Exchange buffer
50–100 nM 目標 GTPase
0.5–2 μM 熒光核苷酸類似物
待測 GEF 蛋白(濃度范圍:1–500 nM,根據預實驗確定)
陽性對照孔:加入 hDbs 蛋白(終濃度約 10–50 nM)
陰性對照孔:不加 GEF 或用 Exchange buffer 替代
3. 熒光監測
將反應板置于溫控熒光讀數儀中,設定激發 485 nm,發射 535 nm。
溫度控制:22°C 或 30°C(根據 GEF 活性最適溫度調整)。
每 30–60 秒讀取一次熒光值,持續 1–2 小時。
4. 數據分析
計算每個時間點的熒光強度變化(ΔF = F? – F?)。
對時間作圖,曲線斜率為初始交換速率。
將待測 GEF 孔的速率與陰性對照孔比較,計算相對活性。
陽性對照(hDbs)應顯示出顯著高于背景的熒光增強。
七、關鍵特性總結
特性 | 描述
檢測方法 | 熒光法(Ex 485 nm / Em 535 nm)
檢測靶點 | Cdc42、Rac1、RhoA
陽性對照 | hDbs(人 Dbs 蛋白,His 標簽)
適用樣本 | 純化蛋白(不適用于細胞裂解液)
檢測通量 | 96 孔或 384 孔板格式
檢測時長 | 約 2 小時
主要用途 | GEF 鑒定、生化表征、抑制劑高通量篩選
八、注意事項與優化建議
1. 不適用細胞裂解液:裂解液中含有核苷酸、鹽分及其他干擾物質,會嚴重影響熒光核苷酸類似物的結合特異性,導致假陽性或假陰性結果。必須使用純化的待測 GEF 蛋白。
2. GTPase 預加載:部分實驗方案建議先將 GTPase 與未標記 GDP 孵育,以確保其處于 GDP 結合狀態,提高交換效率。本試劑盒的 Exchange buffer 已優化,但用戶可根據經驗進行調整。
3. 蛋白濃度優化:不同 GEF 的催化效率差異可達 1000 倍以上,建議對待測 GEF 進行濃度梯度預實驗(例如 1、10、100、500 nM)。
4. 陽性對照驗證:首次使用試劑盒時,務必運行 hDbs 陽性對照孔,以確認試劑盒組分活性。hDbs 對 RhoA 和 Cdc42 均有交換活性,對 Rac1 活性較弱,可作為底物特異性參照。
5. 高通量篩選格式:使用 384 孔板時,反應體積可縮小至 20–30 μl。推薦使用自動液體工作站以確保加樣精度。篩選抑制劑時,先加入化合物與 GEF 預孵育 10–15 分鐘,再加入 GTPase 和熒光核苷酸類似物啟動反應。
6. 數據標準化:將待測孔熒光速率與陽性對照孔(設為 100%)和陰性對照孔(設為 0%)進行比較,計算相對活性百分比。
警告:本產品僅限研究使用,不適用于人類或獸醫治療。
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