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由于環(huán)境因素和細(xì)胞內(nèi)正常的新陳代謝過程,DNA損傷每天以每個細(xì)胞1000到100萬個分子損傷的速度發(fā)生。雖然這只占人類基因組約60億個堿基(30億個堿基對)的一小部分,但關(guān)鍵基因的未修復(fù)損傷可能會阻礙細(xì)胞發(fā)揮其功能的能力,并顯著增加癌癥的可能性。
彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是一種超靈敏的單細(xì)胞水平上檢測DNA損傷的技術(shù),可以檢測到1.657×10-15中0.1個DNA的斷裂,甚至檢出自然光照射體外淋巴細(xì)胞1h后引起的DNA損傷。在電泳場下,損傷的細(xì)胞DNA(包含碎片和鏈斷裂)從完整的DNA中分離出來,在顯微鏡下形成典型的“彗星尾巴”形狀。DNA損傷的程度通常是通過測量彗星尾巴來目測的,也可以使用圖像分析軟件來測量各種參數(shù)。
【彗星分析應(yīng)用領(lǐng)域】:主要還是在細(xì)胞凋亡的研究,腫瘤/癌癥研究,毒理學(xué)研究,環(huán)境污染監(jiān)測,臨床診斷與治療監(jiān)測。
下面就由小艾為您分享一下彗星分析實(shí)驗(yàn)(Comet assay)怎么做?
《》First,選擇專業(yè)的彗星分析試劑盒:OxiSelect™ Comet Assay Kit
根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)用量,可以選擇不同規(guī)格的產(chǎn)品:
| 產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
彗星分析試劑盒 Comet Assay Kits | D-AKE3040-15T | 15T |
* 每個玻片表面都經(jīng)過特殊處理,一旦電泳過,即使玻片上有未使用的孔,也不能用于第二次實(shí)驗(yàn)。
* 3孔和96孔玻片,均可以單獨(dú)購買,請咨詢艾美捷科技。
艾美捷向您推薦Comet Assay kit彗星分析試劑盒內(nèi)提供了彗星分析所需的所有必需試劑,包括裂解液、彗星分析低熔點(diǎn)凝膠、DNA熒光染料、彗星分析玻片以及其它試劑。助您輕松完成彗星實(shí)驗(yàn)分析。
【英文說明書】下載 后仔細(xì)閱讀哦~
*(中文版說明書,已安排翻譯中,敬請期待)
》Second, 彗星分析電泳模式選擇
| 電泳模式 | 檢測類型 | 電泳時間 | 說明 |
| TBE電泳(中性電泳) | 檢測單鏈和雙鏈DNA的斷裂 | 推薦 10-15 mins | 分析細(xì)胞凋亡的首選方法,可使用尾巴長度而非尾矩進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。 |
| 堿性電泳 | 檢測單鏈和雙鏈DNA的斷裂,AP位點(diǎn)損傷在內(nèi)的所有DNA 損傷 | 推薦 15-30mins | 靈敏度最高! |
* 實(shí)驗(yàn)過程中的各類緩沖液都需要4℃預(yù)冷。
關(guān)于電泳電壓:以上2種電泳模式,均推薦參考您實(shí)驗(yàn)室電泳槽兩極間的舉例,按照1V/cm的標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置電壓。舉例,如果電泳槽兩極舉例是35cm,您需要使用35V的電壓來執(zhí)行電泳。
實(shí)驗(yàn)環(huán)境:為避免紫外線對細(xì)胞樣品造成額外損害,請?jiān)谌豕鈼l件下進(jìn)行。
說明書或者文獻(xiàn)中的結(jié)果數(shù)據(jù)是否可以作為我自己實(shí)驗(yàn)的參考結(jié)果呢?
這是一個很好的問題,也是問得最多的問題。但與ELISA不同,Comet Assay不提供對照,因?yàn)槿魏蜟omet Assay的結(jié)果都將根據(jù)實(shí)驗(yàn)條件而變化。 例如,如果電泳運(yùn)行條件不同,則包含相同數(shù)量DNA損傷的細(xì)胞的尾巴大小可能會不同。 與我們的結(jié)果或其他研究人員的結(jié)果進(jìn)行比較將毫無意義,因?yàn)閮烧咧g的條件永遠(yuǎn)不會相同。如果您有興趣測試化合物對DNA損傷的影響,建議使所有條件在實(shí)驗(yàn)之間保持一致,并使用相同的運(yùn)行時間和軟件進(jìn)行分析。
》Fourth,彗星分析結(jié)果計算
通過測量細(xì)胞核遺傳物質(zhì)(“彗頭”)與產(chǎn)生的“尾巴”之間的位移,可以量化DNA損傷。 尾矩(Tail Moment)和尾巴DNA%(Tail DNA% )是分析彗星分析結(jié)果的兩個最常見的參數(shù)。 每個樣品至少應(yīng)分析50 -100個細(xì)胞。考慮到遺傳物質(zhì)的遷移以及尾巴中DNA的相對數(shù)量,通常建議使用尾矩作為評估DNA損傷的指標(biāo)。
| Tail DNA% = 100 x Tail DNA 熒光強(qiáng)度/整個Cell DNA 熒光強(qiáng)度 |
| 尾矩(Tail Moment )可以使用以下方法之一進(jìn)行測量: |
| 1. 橄欖尾矩(Olive Tail Moment)= Tail DNA% x Tail Monent Length (頭中心與尾中心之間的長度)【左圖下】 |
| 2. 延伸尾矩(Extent Tail Moment) = Tail DNA% x Length of Tail【左圖上】 |
| 建議使用軟件的推薦參數(shù)進(jìn)行測量 |
有沒有配套的彗星實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析軟件呢?
這個還真有,小艾查閱了產(chǎn)品說明書,引用文獻(xiàn),已經(jīng)彗星分析相關(guān)的發(fā)表文章,發(fā)現(xiàn)有如下3種主流的軟件可用(均有文獻(xiàn))。根據(jù)您的經(jīng)驗(yàn)和需求進(jìn)行選擇。
*很遺憾,小艾也沒有親自做過此類實(shí)驗(yàn),所以每次有小伙伴求指導(dǎo)的時候,我們也很為難,為了避免誤導(dǎo),只能盡力提供相關(guān)資料給您閱讀了。
| 軟件名稱 | 說明 | 鏈接 |
| OpenComet | 免費(fèi);是Image J軟件的一款彗星分析插件 | 下載頁面 |
| CaspLab (CASP) | 免費(fèi);獨(dú)立軟件 | 下載頁面 |
| Comet Assay IV | 付費(fèi)軟件;可試用1周 | 下載頁面 |
作為一家具有高端的技術(shù)實(shí)力、先進(jìn)的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè),總部位于武漢光谷高新技術(shù)開發(fā)區(qū),服務(wù)面向全國。艾美捷科技是集進(jìn)口試劑、實(shí)驗(yàn)室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品、整合的解決方案,及優(yōu)質(zhì)的物流服務(wù)。為了更好的服務(wù)客戶,公司組建了一支經(jīng)驗(yàn)豐富的研發(fā)團(tuán)隊(duì)-艾美捷生物技術(shù)中心,進(jìn)入研發(fā)生產(chǎn)階段,將更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品推薦給國內(nèi)生物領(lǐng)域的同仁們!
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