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產(chǎn)品應(yīng)用

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DNA甲基化

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時(shí)間:2021-04-26     
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DNA甲基化的研究目前也是熱門(mén)的研究之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而調(diào)控基因性狀的表達(dá)。 基因表達(dá)以及幾乎所有類(lèi)型的癌癥的發(fā)展也與DNA甲基化有關(guān)。


什么是DNA甲基化呢?DNA甲基化是通過(guò)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶在胞嘧啶環(huán)的第5個(gè)碳原子上共價(jià)加成甲基而產(chǎn)生的,從而產(chǎn)生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在體細(xì)胞中,幾乎僅在二核苷酸CpG的對(duì)稱甲基化配對(duì)中發(fā)現(xiàn)了5-mC,而在胚胎干(ES)細(xì)胞中,在非CpG中也觀察到了大量的5-mC。5-mC作為表型和基因表達(dá)的主要表觀遺傳修飾的生物學(xué)重要性已得到廣泛認(rèn)可。


那么有哪些研究方向和方法以及產(chǎn)品值得推薦的產(chǎn)品來(lái)研究DNA甲基化呢?

對(duì)甲基化的研究,總的來(lái)說(shuō)大致可以分為三大類(lèi):

1、針對(duì)DNA甲基化這類(lèi)的研究最多,其中修飾也是最為穩(wěn)定的類(lèi)型;

2、組蛋白的甲基化修飾以及乙酰化;

3、RNA甲基化修飾,雖然RNA的修飾有100多種,但主要以A堿基上的6mA甲基化修飾為主,現(xiàn)在關(guān)于此的研究也非常火。


研究第一步:DNA提取與DNA甲基化定量檢測(cè)

Epigentek可提供相關(guān)的DNA準(zhǔn)備試劑盒,DNA樣品可以從細(xì)胞,組織和體液中制備,并且是大多數(shù)DNA甲基化應(yīng)用和測(cè)定法中最常用的起始材料。高效,精確和高質(zhì)量的DNA分離是成功進(jìn)行基于DNA的實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵前提。


詳情查看:1、表觀遺傳之DNA甲基化<一>


研究第二步:研究DNA甲基化的技術(shù)手段:一類(lèi)是IP類(lèi)的,代表作就是DNA甲基化免疫共沉淀技術(shù)(MeDIP-seq),另外一類(lèi)重亞硫酸鹽處理技術(shù)。詳細(xì)介紹和產(chǎn)品推薦點(diǎn)擊下方信息:


詳情查看:1、表觀遺傳之DNA甲基化<二>


進(jìn)階研究:如何檢測(cè)單個(gè)基因的5mC、5hmC和m6A的量呢?


詳情查看:1、如何定量檢測(cè)目的基因甲基化水平——m6A? 5mC?5hmC?


產(chǎn)品推薦

一、DNA樣本提取試劑盒



FitAmp通用組織切片DNA分離試劑盒Cat #P-1003FitAmp血漿/血清DNA分離試劑盒
cat#p-1004
FitAmp尿液DNA分離試劑盒


cat#p-1017

FitAmp血液和培養(yǎng)細(xì)胞DNA提取試劑盒
cat#p-1018
FitAmp凝膠DNA分離試劑盒


cat#p-1007

FitAmp石蠟組織切片DNA分離試劑盒
cat#p-1009
形式spin columnspin columnspin columnspin columnspin columnspin column
結(jié)合能力5 ?g5 ?g5 ?g5 ?g5 ?g5 ?g
回收率>70%>70%>70%>70%>70%>70%
起始材料組織切片血漿,血清或體液尿液血液白細(xì)胞或培養(yǎng)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠福爾馬林固定,石蠟包埋的組織
輸入量低至1 ng低至1 ng1 ng to 2 ?g1 ng to 4 ?g1 ng to 1 ?g1 ng to 2 ?g
時(shí)間2h12min20min20min<15min2h

 

二、DNA甲基化定量檢測(cè)試劑



MethylFlash甲基化DNA定量試劑盒(比色)
Cat #P-1034
MethylFlash Global
DNA甲基化(5-mC)ELISA簡(jiǎn)易試劑盒(比色)
Cat #P-1030
MethylFlash Global
DNA羥甲基化(5-hmC)ELISA簡(jiǎn)易試劑盒(比色)
Cat #P-1032
MethylFlash 5-甲酰基胞嘧啶(5-fC)DNA定量試劑盒(比色)
Cat #P-1041
目的比色法檢測(cè)DNA中的5mC比色法檢測(cè)DNA中的5mC比色法檢測(cè)DNA中的5hmC比色法檢測(cè)DNA中的5fC
關(guān)鍵點(diǎn)在主要期刊中被高度引用的方法
與HPLC-MS可比的結(jié)果
減少交叉變化并提高準(zhǔn)確性
快速便捷的“一步式”測(cè)定反應(yīng)
強(qiáng)大的第四代MethylFlash技術(shù)應(yīng)用于5hmC研究強(qiáng)大的MethylFlash技術(shù)應(yīng)用于5fC研究
起始材料DNADNADNADNA
輸入范圍50-200 ng20-200 ng50-200 ng100-300 ng
最佳輸入量100 ng100 ng100 ng300 ng
總時(shí)長(zhǎng)4 hours2 hours2 hours4 hours
檢測(cè)閾值200 pg of meDNA50 pg of meDNA10 pg of hMeDNA1 pg of fC DNA
檢測(cè)到的甲基化類(lèi)型5-甲基胞嘧啶5-甲基胞嘧啶5-羥甲基胞嘧啶5-甲酰基胞嘧啶
特異性>1000:1 meDNA:unMeDNA>1000:1 meDNA:unMeDNA>1000:1 hMeDNA:unMeDNA>1000:1 fC DNA:unMeDNA
形式ELISA-like Microplate-basedELISA-like Microplate-basedELISA-like Microplate-basedELISA-like Microplate-based

 

三、DNA甲基化修飾相關(guān)產(chǎn)品:利用DNA甲基化修飾研究手段——DNA亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化技術(shù)產(chǎn)品推薦:

 


Methylamp DNA Modification Kit
Cat #P-1001
BisulFlash DNA Modification Kit
Cat #P-1026
Methylamp Whole Cell Bisulfite Modification Kit
Cat #P-1016
代碼名稱“經(jīng)典”“快速”“直接”
目的基于化學(xué)的DNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化基于快速熱基的DNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化直接從細(xì)胞,組織,唾液,尿液或血液中轉(zhuǎn)化
關(guān)鍵點(diǎn)1. 兼容Illumina工作流程
2. 最堅(jiān)固可靠
3. 亞硫酸氫鹽測(cè)序,NGS和各種MSP的理想選擇
1. 極快
2. 實(shí)時(shí)MSP的理想選擇
3. 可選的測(cè)序方案
1. 消除了分離DNA的步驟
2. 非常適合包含少量DNA的樣品
起始原料DNADNA細(xì)胞,組織,血液
最低輸入量50 pg200 pg100 細(xì)胞, 1 ?l 血液
操作總時(shí)長(zhǎng)< 2 h30 min< 3 h
洗脫體積8-20 ?l10-20 ?l8-20 ?l
轉(zhuǎn)換效率99.9%99.9%99.9%
脫硫/凈化
回收率>75%>75%>85%
轉(zhuǎn)換后DNA片段大小200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp100-400 bp; Avg. Peak of 250 bp200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp
形式旋轉(zhuǎn)柱旋轉(zhuǎn)柱旋轉(zhuǎn)柱

 

四、甲基化DNA免疫沉淀(meDIP)是一種基于抗體的大規(guī)模技術(shù)



Methylamp甲基化DNA捕獲(MeDIP)試劑盒
Cat #P-1015
EpiQuik羥甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)試劑盒
Cat #P-1038
EpiQuik MeDIP Ultra KitCat #P-1052EpiQuik甲基化DNA免疫沉淀試劑盒
cat#P-2019
EpiQuik組織甲基化DNA免疫沉淀試劑盒
cat#P-2020
目的富集并捕獲甲基化的DNA片段富集并捕獲羥甲基化的DNA片段從低起始輸入中富集并捕獲甲基化的DNA片段直接從細(xì)胞裂解物中富集并捕獲甲基化的DNA片段直接從組織中富集并捕獲甲基化的DNA片段
關(guān)鍵點(diǎn)1. PCR和微陣列的理想選擇
2.兼容Illumina工作流程
1. 與下游工作流程兼容,包括hMeDIP-PCR和hMeDIP-chip1. MeDIP-Seq的理想選擇
2.兼容Illumina
3. 工作流程
最敏感和最具體
1. 通過(guò)直接從細(xì)胞中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分離步驟1. 通過(guò)直接從組織中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分離步驟
起始原料DNADNADNA細(xì)胞組織
最低輸入量0.2-1 ?g0.1 ?g50 ng DNA
(10,000 cells)
100,000 cells10mg
操作總時(shí)長(zhǎng)< 3 hours< 3 hours< 3 hours< 4 hours<3.5h
富集效率> 98%> 99%> 99%> 95%> 95%
轉(zhuǎn)換效率99.9%99.9%99.9%99.9%99.9%
包含高度特異性的抗體
包括DNA純化柱
容器形式96孔板96孔板96孔板96孔板96孔板


五、檢測(cè)A基因的DNA 5mC甲基化水平產(chǎn)品:MSP/IP

 

產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat#p-1026 BisulFlash DNA Modification KitCat#p-1028 Methylamp MS-qPCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1026進(jìn)行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換后甲基化的5-mC保持不變,沒(méi)有甲基化C轉(zhuǎn)換成U。之后用p-1028進(jìn)行MS-qPCR,針對(duì)目的基因設(shè)計(jì)一對(duì)靶向甲基化區(qū)域的引物進(jìn)行PCR即可。而且用我們的MS-qPCR可將時(shí)間縮短到70min(1h 10min)鐘喲,普通的一般需要(2.5h)
Cat# p-1015:Methylamp Methylated DNA Capture (MeDIP) Kit
Cat# p-1052:EpiQuik MeDIP Ultra Kit
Cat# p-1028:Methylamp MS-qPCR Fast Kit
Cat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1015或者p-1052進(jìn)行5mC甲基化DNA下拉富集,再用p-1028進(jìn)行甲基化特異性PCR實(shí)驗(yàn),進(jìn)行特異基因甲基化的定量。也可以使用p-1029進(jìn)行qPCR。(廠家推薦:p-1052&p-1029;)


 六、定量檢測(cè)A基因的 5hmC甲基化水平

 

產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat# p-1038:EpiQuik? Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation (hMeDIP) KitCat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1038進(jìn)行5hmC甲基化DNA下拉富集,再用p-1029,進(jìn)行特異基因5hmC甲基化的定量。

 

七、定量檢測(cè)A基因的 RNA m6A甲基化水平

 

產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat# p-9018:EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit
Cat# 202-003:m6A 抗體
Cat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取RNA,用p-9018進(jìn)行m6A RNA富集,將富集后的m6A RNA進(jìn)行發(fā)轉(zhuǎn)錄后,進(jìn)行qPCR。也可以使用我們的m6A抗體,進(jìn)行IP實(shí)驗(yàn),我們的m6A抗體適用實(shí)驗(yàn)類(lèi)型多,物種廣,參考文獻(xiàn)多,感興趣的歡迎前來(lái)垂詢~~(目前p-9018和202-003都是現(xiàn)貨~~)

 

產(chǎn)品中心分類(lèi)
  • 高品質(zhì)保障 成熟的生產(chǎn)研發(fā)技術(shù)
  • 高性價(jià)比 價(jià)宜質(zhì)優(yōu),性價(jià)比高
  • 高效省心 從購(gòu)買(mǎi)到使用,放心無(wú)憂
  • 安全運(yùn)輸 完善的保護(hù)措施安全運(yùn)輸

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