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如何定量檢測(cè)目的基因甲基化水平

發(fā)布者:艾美捷科技    發(fā)布時(shí)間:2021-03-25     
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今天我給大家來嘮嘮關(guān)于目的基因甲基化檢測(cè)方面(m6A、 5mC和5hmC)的產(chǎn)品搭配,不過我的搭配也只是一種可能的選擇(不過也有文章報(bào)道過我說的方式),所以我今天也只是給大家推薦推薦,看看能不能給小伙伴們的研究帶來一種思路,如果小伙伴覺得可行,可以咨詢小艾進(jìn)行產(chǎn)品問詢,如果您覺得不可行,也歡迎各位小伙伴批評(píng)指正哦~~


具體事情是這樣的,最近收到很多小伙伴的問詢,比如:


“我想要檢測(cè)xxx基因的5mC甲基化水平,請(qǐng)問用您們的Epigentek p-1030試劑盒可以檢測(cè)嗎?”

“我想要檢測(cè)xxx基因的5hmC甲基化水平,用您們的Epigentek的p-1032可以檢測(cè)嗎?”

“請(qǐng)問用p-9005可以檢測(cè)xxx基因的m6A水平嗎?”……


但是呢,上述說的3個(gè)試劑盒p-1030、p-1032和p-9005都是用來檢測(cè)總體水平的5mC、5hmC和m6A的量,不能檢測(cè)單個(gè)基因的。


這么回復(fù)之后,有小伙伴又問:“我是不是可以自己購買特定目標(biāo)基因的抗體用這個(gè)試劑盒進(jìn)行檢測(cè)呢?比如我要檢測(cè)A基因的甲基化,我去購買A基因的抗體,搭配這個(gè)試劑盒檢測(cè)可以嗎?”


RE: 不可以哦,這個(gè)試劑盒里面的抗體是專門針對(duì)這些修飾位點(diǎn)進(jìn)行設(shè)計(jì)的,也是經(jīng)過廠家驗(yàn)證能夠匹配整個(gè)試劑盒使用的,所以如果您用自己的抗體來進(jìn)行實(shí)驗(yàn),很可能是檢測(cè)不到的呢。如果您能提取單個(gè)基因的DNA或者RNA樣本,倒是可以用這些試劑盒檢測(cè)。不過有點(diǎn)難呢,當(dāng)然客戶可以自行嘗試~~

“那有可以檢測(cè)單個(gè)基因的產(chǎn)品推薦嗎?我不要檢測(cè)總的,就要檢測(cè)單基因的。”

相信有很多小伙伴對(duì)這方面很感興趣。接下來我們就大家說說我“建議”的思路。


1.如何定量檢測(cè)A基因的DNA 5mC甲基化水平?


關(guān)于DNA 5mC甲基化水平的檢測(cè),如果是檢測(cè)總的,那很好辦,一個(gè)p-1030或者p-1034就可以搞定,簡(jiǎn)單快捷,結(jié)果還好看。但是針對(duì)特定基因的話,就不能用這個(gè)產(chǎn)品了。我這邊的思路主要2個(gè):


【1】關(guān)于特異基因的甲基化修飾檢測(cè)我想大家有個(gè)先入為主的概念就是MSP或者BSP。BSP是甲基化檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn),不過我今天就不細(xì)說了。主要說說MSP—甲基化特異性PCR。MSP的實(shí)驗(yàn)過程簡(jiǎn)單來說就是提取樣本中的DNA進(jìn)行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換,最后將轉(zhuǎn)換的DNA進(jìn)行定量PCR,由此來確定特異基因甲基化修飾。


產(chǎn)品搭配:


產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat#p-1026 BisulFlash DNA Modification KitCat#p-1028 Methylamp MS-qPCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1026進(jìn)行亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換后甲基化的5-mC保持不變,沒有甲基化C轉(zhuǎn)換成U。之后用p-1028進(jìn)行MS-qPCR,針對(duì)目的基因設(shè)計(jì)一對(duì)靶向甲基化區(qū)域的引物進(jìn)行PCR即可。而且用我們的MS-qPCR可將時(shí)間縮短到70min(1h 10min)鐘喲,普通的一般需要(2.5h)


產(chǎn)品轉(zhuǎn)換流程和結(jié)果展示:


BisulFlash DNA Modification Kit


【2】IP。IP是個(gè)非常常用的技術(shù)手段,幾乎聽到IP大家都能知道這是干啥的。不過大家也有個(gè)先入為主的概念,就是IP只能下拉蛋白,是不是?IP抗體+磁珠,下拉下來的不就是蛋白嘛!但是,我們的IP試劑盒產(chǎn)品是可以下拉DNA和RNA的。我們現(xiàn)在需要的是含有5mC的DNA對(duì)吧?我們有專門的IP試劑盒下拉所有含有5mC的DNA。


產(chǎn)品搭配方案:


產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat# p-1015:Methylamp Methylated DNA Capture (MeDIP) Kit
Cat# p-1052:EpiQuik MeDIP Ultra Kit
Cat# p-1028:Methylamp MS-qPCR Fast Kit
Cat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1015或者p-1052進(jìn)行5mC甲基化DNA下拉富集,再用p-1028進(jìn)行甲基化特異性PCR實(shí)驗(yàn),進(jìn)行特異基因甲基化的定量。也可以使用p-1029進(jìn)行qPCR。(廠家推薦:p-1052&p-1029;)


產(chǎn)品富集流程+結(jié)果展示:


EpiQuik MeDIP Ultra Kit

EpiQuik MeDIP Ultra Kit


2.如何定量檢測(cè)A基因的 5hmC甲基化水平?


關(guān)于DNA羥甲基化的定量檢測(cè),我們檢測(cè)總的話就是p-1032,基于ELISA的方法,可進(jìn)行絕對(duì)的定量。而特異基因的5hmC檢測(cè)參照的方式與5mC的一樣,也是先IP下來所有的5hmC DNA,再進(jìn)行定量檢測(cè)。


產(chǎn)品搭配:


產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat# p-1038:EpiQuik? Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation (hMeDIP) KitCat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取DNA,再用p-1038進(jìn)行5hmC甲基化DNA下拉富集,再用p-1029,進(jìn)行特異基因5hmC甲基化的定量。


產(chǎn)品富集流程+結(jié)果展示:


EpiQuik? Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation (hMeDIP) Kit

EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit


3.如何定量檢測(cè)A基因的 RNA m6A甲基化水平?


檢測(cè)總的RNA m6A的量我們常用的是p-9005,而且這個(gè)產(chǎn)品我們賣的非常火,購買的人也非常的多,同時(shí)參考文獻(xiàn)也很多,我們是有現(xiàn)貨的。所以因?yàn)檫@個(gè)產(chǎn)品好用名氣大,所以很多小伙伴想用這個(gè)試劑盒來檢測(cè)單個(gè)基因的m6A的量。但是,這個(gè)產(chǎn)品也不能檢測(cè)單個(gè)基因的RNA m6A的量。所以,至于如何進(jìn)行單個(gè)基因的,我推薦的思路與前面DNA的5mC和5hmC是一樣的。也是先進(jìn)行IP,再進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn),這里就多了一步反轉(zhuǎn)錄。


產(chǎn)品搭配:


產(chǎn)品A產(chǎn)品B
Cat# p-9018:EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit
Cat# 202-003:m6A 抗體
Cat# p-1029:  EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit
搭配描述:客戶可用自己的方式提取RNA,用p-9018進(jìn)行m6A RNA富集,將富集后的m6A RNA進(jìn)行發(fā)轉(zhuǎn)錄后,進(jìn)行qPCR。也可以使用我們的m6A抗體,進(jìn)行IP實(shí)驗(yàn),我們的m6A抗體適用實(shí)驗(yàn)類型多,物種廣,參考文獻(xiàn)多,感興趣的歡迎前來垂詢~~(目前p-9018和202-003都是現(xiàn)貨~~)


產(chǎn)品富集流程+結(jié)果展示:


m6A 抗體

m6A RNA富集


當(dāng)然,我們的產(chǎn)品不止我提到的這些,還有其他的產(chǎn)品可供選擇,大家若是感興趣,可以咨詢小艾喲~~~


作為一家具有高端的技術(shù)實(shí)力、先進(jìn)的經(jīng)營(yíng)管理水平和完善的市場(chǎng)銷售體系的生物高科技企業(yè),總部位于武漢光谷高新技術(shù)開發(fā)區(qū),服務(wù)面向全國(guó)。艾美捷科技是集進(jìn)口試劑、實(shí)驗(yàn)室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品、整合的解決方案,及優(yōu)質(zhì)的物流服務(wù)。為了更好的服務(wù)客戶,公司組建了一支經(jīng)驗(yàn)豐富的研發(fā)團(tuán)隊(duì)-艾美捷生物技術(shù)中心,進(jìn)入研發(fā)生產(chǎn)階段,將更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品推薦給國(guó)內(nèi)生物領(lǐng)域的同仁們!


艾美捷科技與國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀的生物試劑供應(yīng)商優(yōu)保持著密切的合作關(guān)系,目前已成為眾多國(guó)際知名品牌的中國(guó)總代理或一級(jí)代理,主要包括:AmyJet、AmyJet、AAT Bioquest、Abbexa、Abnova、Agrisera、Anogen、Biosensis、Biovision、Caisson Labs、Cayman Chemical、Cell Biolabs、Cytoskeleton、Demeditec、Duchefa、Epigentek、Equitech-Bio、EXBio、Fitzgerald、GeneCopoeia、Hycult Biotech、ImmunoReagents、ImmunoStep、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、Mabtech、Matreya、Norgen Biotek、Origene、ProImmune、ProSpec、ScyTek、Solis BioDyne、SouthernBiotech、StressMarq、SySy、US Biological、TRC等,可以在短時(shí)間內(nèi)為用戶提供專業(yè)的前沿資訊、完備的產(chǎn)品及物流服務(wù)。

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