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miRNA是許多人類病理學(xué)中有潛力的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物,如何準(zhǔn)確對(duì)miRNA進(jìn)行定量呢?前期我們介紹了免疫法定量miRNA的試劑盒,今天介紹常規(guī)基于PCR法的miRNA定量的試劑盒——雙尾RT-qPCR。
傳統(tǒng)microRNA PCR檢測方法的痛點(diǎn):用傳統(tǒng)的PCR法檢測microRNA的挑戰(zhàn)在于,兩個(gè)常規(guī)PCR引物的總長度幾乎是microRNA長度的兩倍,因此不適合于做miRNA的引物。以前的技術(shù)通過使用發(fā)夾引物延伸microRNA,添加poly A尾巴或通過連接添加片段來解決這個(gè)問題,但是這會(huì)降低檢測的靈敏度和特異性。此外,這些方法無法檢測在3'末端修飾的microRNA,因?yàn)樗鼤?huì)干擾延伸過程。

市面上常見的miRNA定量檢測試劑盒原理
BioVendor專利產(chǎn)品——雙尾RT-qPCR
我們專利的雙尾RT-qPCR技術(shù),具有獨(dú)特的RT引物機(jī)制,與其他方法相比,可提供出色的靈敏度和特異性。雙尾RT-qPCR技術(shù)已被開發(fā)用于總的miRNA和piRNA的定量。
雙尾RT-qPCR原理:與使用單個(gè)結(jié)合探針不同,雙尾PCR使用兩個(gè)半探針,它們分別結(jié)合到不同的microRNA片段上,這些片段通過折疊的系鏈連接。雖然每個(gè)半探針本身都很短, 無法結(jié)合到microRNA上,但當(dāng)兩個(gè)半探針互補(bǔ)時(shí),它們會(huì)協(xié)同結(jié)合,這種結(jié)合的特異性是非常高的,因?yàn)樵诙贪胩结樦绣e(cuò)配的影響非常大。然后可以使用兩個(gè)特定序列引物對(duì)形成的cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,用SYBR進(jìn)行檢測。

雙尾RT-qPCR優(yōu)勢:
高靈敏度(最多少于10個(gè)分子)
高特異性
適合于多種樣本(血漿/血清,血液,組織等)中的miRNA檢測和定量
通過折疊的系鏈連接的兩個(gè)半探針(結(jié)合不同的microRNA片段)
動(dòng)態(tài)范圍廣(高達(dá)9 log)
在進(jìn)行單重qPCR之前,可進(jìn)行雙管多重RT-PCR
提供定制化服務(wù)
1.高靈敏度及特異性:
5?互補(bǔ)片段顯著提高分析的靈敏度:

5? 互補(bǔ)片段顯著提高檢測的特異性:

5′-hemiprobe的特異性及靈敏度驗(yàn)證:為了測試5′-hemiprobe對(duì)特異性的貢獻(xiàn),我們比較了兩種雙尾RT引物區(qū)分Let-7 miRNA家族的兩個(gè)成員:Let-7a和Let-7f的能力,它們僅有位于miRNA序列中心的單個(gè)核苷酸的差異。RT 1引物的5'-hemiprobe設(shè)計(jì)成與let-7a的5'-末端的前十個(gè)核苷酸結(jié)合, 而RT 2引物的5'-hemiprobe結(jié)合在let-7a的8個(gè)核苷酸上,通過這種設(shè)計(jì),區(qū)分let-7a和let-7f的核苷酸只是由RT 2引物的5′-hemiprobe檢測的,而不是由RT 1引物檢測的。RT 2引物的5′-hemiprobe也很短(8個(gè)核苷酸),因?yàn)槲覀冋J(rèn)為探針序列較短時(shí)錯(cuò)配的影響會(huì)更加明顯。其余的RT 1和RT 2引物序列以及所用的PCR引物是完全相同的。使用RT 2引物時(shí),完全匹配和錯(cuò)配的模板之間的ΔCq(ΔCq= 11.07)顯著大于使用RT 1引物(ΔCq = 4.66),不帶有5′-hemiprobe的不同堿基重疊的RT 2引物,而不是不帶有RT 1引物的RT 2引物。這證明了5'-半探針對(duì)系統(tǒng)特異性的重大貢獻(xiàn)。值得注意的是,兩種雙尾RT引物完全互補(bǔ)的let-7a microRNA的Cq值相等,表明即使5′-hemiprobe的長度有兩個(gè)堿基的不同,檢測靈敏度仍然相同。
2.適用樣本類型豐富:
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| 血漿/ 血清/ 尿液/ 腦脊液/ 生物液體 | 新鮮組織,冷凍/福爾馬林固定組織的 |
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| 細(xì)胞,外泌體 | |
3.miRNA定量的試劑盒檢測流程簡便:

相關(guān)miRNA定量的試劑盒產(chǎn)品推薦:
| 產(chǎn)品貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 品牌 |
| RMR001R | miRNA Isolation Kit Cells-Exosomes | BioVendor |
| RMR002R | miRNA Isolation Kit Plasma-Serum | BioVendor |
| RMR003R | miRNA Isolation Kit FFPE | BioVendor |
| RMR004R | miRNA Isolation Kit Tissues | BioVendor |
| RDTTRT50 | TT cDNA synthesis system - 50 rxns | BioVendor |
| RDTTPCR150 | TT qPCR MasterMix - 150 rxns | BioVendor |
| RDTT000****PRI | TT assay primers (RT+qPCR) - 50+150 rxns | BioVendor |
| RDM00*** | miREIA complex kit - 96 well format | BioVendor |
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