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拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase)是一類在DNA復(fù)制、重組、轉(zhuǎn)錄和修復(fù)過程中起關(guān)鍵作用的酶。根據(jù)催化功能和氨基酸序列,人的拓?fù)洚悩?gòu)酶主要分為兩類:拓?fù)洚悩?gòu)酶I(Topoisomerase I)和拓?fù)洚悩?gòu)酶II(Topoisomerase II)。拓?fù)洚悩?gòu)酶I通過切割DNA單鏈發(fā)揮作用,而拓?fù)洚悩?gòu)酶II則切割DNA雙鏈。這兩種酶在癌癥治療中具有重要意義,因?yàn)樗鼈冊(cè)谀承┌┘?xì)胞中高表達(dá),因此成為抗癌藥物的重要靶點(diǎn)。然而,現(xiàn)有的拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑(如道諾霉素、米托蒽醌、替尼泊苷、依托泊苷、伊立替康和拓?fù)涮婵担╇m然在臨床上用于治療癌癥,但副作用嚴(yán)重,如心臟毒性、免疫系統(tǒng)抑制、震顫和發(fā)熱等。因此,尋找毒性更小的新型拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑具有重要意義。
貓眼草黃素(Chrysosplenetin)是一種甲氧基黃酮類化合物,廣泛存在于某些菊科植物中,如德國洋甘菊(Chamomilla recutita)和青蒿(Artemisia annua)。它具有多種生物活性,包括抗骨質(zhì)疏松、抗酪氨酸酶和抗神經(jīng)氨酸酶活性,以及抗菌和抗癌作用。特別是,它對(duì)乳腺癌細(xì)胞系(如MCF-7、MDA-MB-231和T47D)具有選擇性抑制作用,而對(duì)正常非腫瘤細(xì)胞(如MRC-5和HUVEC)的毒性較小。”In vitro and in silico assessment of DNA interaction, topoisomerase I and II inhibition properties of (Chrysosplenetin)” 主要研究了天然黃酮類化合物貓眼草黃素與DNA的相互作用及其對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II的抑制作用。

貓眼草黃素與拓?fù)洚悩?gòu)酶I和拓?fù)洚悩?gòu)酶II共價(jià)DNA復(fù)合物的結(jié)合(A、B)和相互作用(C、D)模式。貓眼草黃素以棒狀圖表示,拓?fù)洚悩?gòu)酶的主鏈以帶狀圖表示,DNA分子則根據(jù)原子的靜電勢(shì)以分子表面渲染,顏色漸變從紅色到白色再到藍(lán)色,其中紅色代表最低的勢(shì)能,藍(lán)色代表最高的勢(shì)能。
實(shí)驗(yàn)方法
材料與試劑:實(shí)驗(yàn)中使用了貓眼草黃素(從青蒿中提取,純度>95%)、pBR322超螺旋質(zhì)粒DNA、人拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II(均購自Topogen)、細(xì)胞培養(yǎng)基、MTS細(xì)胞增殖檢測(cè)試劑盒等試劑。
貨號(hào) | ||
名稱 | Human Topoisomerase I Enzyme 人拓?fù)洚悩?gòu)酶I | Human Topoisomerase IIα Enzyme 人拓?fù)洚悩?gòu)酶IIα |
說明 | 高純度,具有催化活性的Top1酶在桿狀病毒系統(tǒng)中過表達(dá),純化為單帶均勻性。這些制劑比由人體組織制成的天然topo I便宜,并且具有優(yōu)良的純度和高比活性。 | 純化后的酶完全沒有污染和核酸酶。SDS-PAGE上檢測(cè)到的主要多肽為170 kDa。 |
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細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn):通過MTS法評(píng)估貓眼草黃素對(duì)MCF-7乳腺癌細(xì)胞系的細(xì)胞毒性。將細(xì)胞接種于96孔板中,加入不同濃度的貓眼草黃素孵育72小時(shí)后,測(cè)定細(xì)胞增殖情況。
DNA水解切割實(shí)驗(yàn):使用瓊脂糖凝膠電泳評(píng)估貓眼草黃素對(duì)pBR322超螺旋質(zhì)粒DNA的水解切割作用。將DNA與不同濃度的貓眼草黃素孵育后,觀察DNA形態(tài)的變化。
DNA保護(hù)實(shí)驗(yàn):通過Fenton反應(yīng)產(chǎn)生羥基自由基,評(píng)估貓眼草黃素對(duì)pBR322超螺旋質(zhì)粒DNA的氧化損傷保護(hù)作用。將DNA與Fenton試劑及不同濃度的貓眼草黃素孵育后,觀察DNA形態(tài)的變化。
拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制實(shí)驗(yàn):使用瓊脂糖凝膠電泳評(píng)估貓眼草黃素對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II的抑制作用。將超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA與拓?fù)洚悩?gòu)酶及不同濃度的貓眼草黃素孵育后,觀察DNA形態(tài)的變化。
分子對(duì)接研究:使用AutoDockTools和MacroModel軟件進(jìn)行分子對(duì)接研究,評(píng)估貓眼草黃素與DNA及拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II的結(jié)合模式和親和力。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
細(xì)胞毒性:貓眼草黃素對(duì)MCF-7細(xì)胞具有顯著的細(xì)胞毒性,IC50值為0.29μM。這與先前的研究結(jié)果一致,表明貓眼草黃素對(duì)乳腺癌細(xì)胞具有顯著的抑制作用。
DNA水解切割:在不同濃度的貓眼草黃素作用下,pBR322超螺旋質(zhì)粒DNA的形態(tài)未發(fā)生變化,表明貓眼草黃素未引起DNA的水解切割。
DNA保護(hù):貓眼草黃素以濃度依賴的方式顯著保護(hù)了pBR322超螺旋質(zhì)粒DNA免受Fenton反應(yīng)產(chǎn)生的羥基自由基的損傷。這表明貓眼草黃素具有抗氧化和DNA保護(hù)作用。
拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制:貓眼草黃素對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II均表現(xiàn)出顯著的抑制作用。特別是在12.5-100μM濃度范圍內(nèi),對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶II的抑制率達(dá)到了83-96%。這表明貓眼草黃素可能通過抑制拓?fù)洚悩?gòu)酶的活性來發(fā)揮其抗癌作用。
分子對(duì)接研究:分子對(duì)接研究表明,貓眼草黃素能夠通過插入或溝槽結(jié)合的方式與DNA結(jié)合,并通過與拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II的活性位點(diǎn)結(jié)合來抑制其活性。這些結(jié)果進(jìn)一步支持了貓眼草黃素作為潛在抗癌藥物的潛力。
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貓眼草黃素對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶I的抑制作用。1:DNA對(duì)照;2: DNA + 1u拓?fù)洚悩?gòu)酶;3-6:DNA + 1u拓?fù)洚悩?gòu)酶I +黃銅礦素(12.5, 25, 50, 100 μm)。 | 貓眼草黃素對(duì)拓?fù)洚悩?gòu)酶II的抑制作用。1:DNA對(duì)照;2: DNA + 1u拓?fù)洚悩?gòu)酶;3-6:DNA + 1u拓?fù)洚悩?gòu)酶II +黃銅礦素(12.5, 25, 50, 100 μm)。 |
Topogen品牌的人拓?fù)洚悩?gòu)酶I和II在藥物研發(fā)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。它們不僅可用于篩選和評(píng)估新型抗癌藥物的拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制活性,還可用于研究拓?fù)洚悩?gòu)酶的結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系,以及探索新型抗癌藥物的作用機(jī)制。此外,這些酶還可用于建立高效的藥物篩選平臺(tái),加速抗癌藥物的研發(fā)進(jìn)程。
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