DNA甲基化是在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶（DNA methyltransferase, DNMT）的作用下，以S-腺苷甲硫氨酸（S-adenosyl-methi-onine，SAM）為甲基供體，將甲基轉(zhuǎn)移到DNA分子中特定堿基上的過(guò)程，最常見(jiàn)的是在胞嘧啶上形成5’甲基胞嘧啶。DNA甲基化就像一頂神奇的帽子，在不改變DNA分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的情況下調(diào)節(jié)基因組的功能，在生命活動(dòng)中起著重要作用。

近年來(lái)涌現(xiàn)出很多 DNA 甲基化的檢測(cè)技術(shù)，目前依據(jù)對(duì)目標(biāo) DNA 的預(yù)處理手段可將甲基化檢測(cè)技術(shù)分為 3 類：

基于限制性酶切預(yù)處理的甲基化檢測(cè)技術(shù)；

這種方法是利用甲基化敏感性限制性內(nèi)切酶對(duì)甲基化區(qū)域不切割的特性，將DNA消化為不同大小的片段后再進(jìn)行分析。常用的經(jīng)典酶對(duì)是Hpa II-Msp I（識(shí)別序列CCGG）。隨后進(jìn)行Southern或PCR擴(kuò)增分離產(chǎn)物，以明確目標(biāo)片段的甲基化狀態(tài)。

基于亞硫酸鹽修飾預(yù)處理的甲基化檢測(cè)技術(shù)p；

這種方法是DNA經(jīng)亞硫酸鹽處理后，未甲基化的胞嘧啶（C）被轉(zhuǎn)化成尿嘧啶（U），甲基化的胞嘧啶保持不變。處理后的DNA通過(guò)測(cè)序或使用特異性引物PCR得到非常準(zhǔn)確的DNA序列甲基化位點(diǎn)信息。

基于親和富集預(yù)處理的甲基化檢測(cè)技術(shù)；

 

基于親和富集的 DNA 甲基化檢測(cè)技術(shù)主要有甲基化 DNA 免疫沉淀技術(shù) (MeDIP) 與甲基化 CpG 結(jié)合蛋白親和捕獲技術(shù) (MBDCap)：MeDIP 方法在將基因組 DNA 超聲波打斷并變性后，使用 5- 甲基胞嘧啶特異性抗體富集甲基化片段，再分離純化得到甲基化 DNA 片段，然后再用測(cè)序等方法分析；MBDCap 技術(shù)與 MeDIP 方法類似，利用甲基化DNA結(jié)合蛋白來(lái)對(duì)甲基化的DNA進(jìn)行免疫沉淀，因?yàn)椴捎玫母患鞍撞煌?MeDIP 普遍富集 CpG 低密度的甲基化區(qū)域，而 MBDCap 則普遍富集 CpG 高密度的甲基化區(qū)域 。

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