TECHNICAL COLUMN
常見問題做組織樣品的western 的時候,怎樣處理樣品?
必須進行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質溶解度會更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,需要注意抑 制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
問一般一次上樣的蛋白總量是多少,跟目的蛋白的表達量有關系嗎?
WesternBlot 一般上樣 30-100 微克不等,結果跟目的蛋白的豐度、上樣量、一二抗的量和孵育 時間都有關系,也與顯色時間長短有關。開始摸條件時,為了拿到陽性結果,各個步驟都可以量多一點 時間長一點,當然背景也就出來了。要拿到好的結果,如果抗體好的話比較容易,抗體不好的話就需要 反復地試了,當然有的不適合 WesternBlot 的怎樣做也不行。
二抗是生物素化的抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否 要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的生成,是 嗎?
不能使用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含生物素,用BSA代替應該好一點.
我所測定的蛋白分子量是 105KD,按理說分離膠應當采用7.5%,但資料卻要求分離膠和濃縮膠均 采用11%的配方,不知為何?
上述提到的兩種凝膠均可以使用,因為105KD 的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意 條帶位置。
蛋白變性后可以存放多久?
-80℃,一兩年沒有問題。最關鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細菌消化掉(也是被 酶水解了)。
如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量?
可以濃縮樣品,也可以根據(jù)你的目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會有 問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試 1.5mm 的。
想分離的蛋白是分子量200kd的,SDS-PAGE 電泳的分離膠濃度多大合適?積層膠的濃度又該用多少?這么大分子量的蛋白容易作 WesternBlot 嗎?
200kd 的蛋白不好做, 分離膠用7%,積層膠3.5%。
我的樣品的蛋白含量很低,每微升不到1 微克,但是在轉膜時經(jīng)常會發(fā)現(xiàn)只有一部分蛋白轉到了膜 上,就是在轉膜后染膠發(fā)現(xiàn)有的孔所有的蛋白條帶都在,只是顏色變淡了,有什么辦法可以解決?
你可以加大上樣量,沒有問題,還有轉移時你可以用減少電流延長時間,加20%甲醇。
如果目標蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么?
如果是膜蛋白和胞漿蛋白,所用的去垢劑要溫和得多,這時最好加上NaF 去抑制磷酸化酶 的活性。
同一蛋白樣品能同時進行兩種因子的WesternBlot 檢測嗎?
當然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品。
同一樣品能同時提 RNA 又提蛋白么?這樣對westernblot 有無影響?
能,沒有問題。
細胞水平要做 westernblot,多少細胞提的蛋白夠做westernblot?
一般5×10^6 就足夠了。
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