與FITC等熒光素衍生物相比，使用iFluor 488染料制備的蛋白質偶聯物要優越得多。

Phalloidin偶聯物以高親和力染色固定和滲透細胞中的F-actin。

這種Cy3-dUTP綴合物可以用Spectrum Orange 濾光片組作為紅色熒光色（Spectrum Oranges 是Vysis的商標）。

據報道，這種OG488 tris-NTA化合物是一種靈敏的熒光探針，用于檢測細胞、溶液和固體表面中的聚組氨酸標記蛋白。

熒光鬼筆環肽衍生物已被用作高分辨率研究肌動蛋白網絡的重要工具。AAT Bioquest提供各種不同顏色的熒光鬼筆環肽衍生物，用于多色成像應用

與常用的綠色探針（如熒光素-12-dUTP）相比，iFluor 488提供了更亮的信號，具有更強的光穩定性，不受pH值的影響。

Fluoro-Jade C可以染色所有退化的神經元，不論其特定損傷或細胞死亡機制。Fluoro-Jade C展現出最大的信號與背景比率，以及最高的分辨率。這轉化為對退化神經元的最大對比度和親和力。

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